Protein–RNA interactions for Protein: P47857

Pfkm, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfkmP47857 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PfkmP47857 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PfkmP47857 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PfkmP47857 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PfkmP47857 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PfkmP47857 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PfkmP47857 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PfkmP47857 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PfkmP47857 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PfkmP47857 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PfkmP47857 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PfkmP47857 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PfkmP47857 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PfkmP47857 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PfkmP47857 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PfkmP47857 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PfkmP47857 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PfkmP47857 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PfkmP47857 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PfkmP47857 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PfkmP47857 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PfkmP47857 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PfkmP47857 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PfkmP47857 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PfkmP47857 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PfkmP47857 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PfkmP47857 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PfkmP47857 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PfkmP47857 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PfkmP47857 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PfkmP47857 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PfkmP47857 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PfkmP47857 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PfkmP47857 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PfkmP47857 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PfkmP47857 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PfkmP47857 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PfkmP47857 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PfkmP47857 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PfkmP47857 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PfkmP47857 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PfkmP47857 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PfkmP47857 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PfkmP47857 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PfkmP47857 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PfkmP47857 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PfkmP47857 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PfkmP47857 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PfkmP47857 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PfkmP47857 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PfkmP47857 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PfkmP47857 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PfkmP47857 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PfkmP47857 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PfkmP47857 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PfkmP47857 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PfkmP47857 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PfkmP47857 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PfkmP47857 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PfkmP47857 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PfkmP47857 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PfkmP47857 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PfkmP47857 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PfkmP47857 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PfkmP47857 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PfkmP47857 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PfkmP47857 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PfkmP47857 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PfkmP47857 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PfkmP47857 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PfkmP47857 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PfkmP47857 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PfkmP47857 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PfkmP47857 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PfkmP47857 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PfkmP47857 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PfkmP47857 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PfkmP47857 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PfkmP47857 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PfkmP47857 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PfkmP47857 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PfkmP47857 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PfkmP47857 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PfkmP47857 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PfkmP47857 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PfkmP47857 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PfkmP47857 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PfkmP47857 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PfkmP47857 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PfkmP47857 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PfkmP47857 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PfkmP47857 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PfkmP47857 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PfkmP47857 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PfkmP47857 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PfkmP47857 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PfkmP47857 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PfkmP47857 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PfkmP47857 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PfkmP47857 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms