Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Grin2aP35436 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Grin2aP35436 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Grin2aP35436 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Grin2aP35436 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Grin2aP35436 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Grin2aP35436 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Grin2aP35436 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Grin2aP35436 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Grin2aP35436 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Grin2aP35436 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Grin2aP35436 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
Grin2aP35436 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Grin2aP35436 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
Grin2aP35436 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Grin2aP35436 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
Grin2aP35436 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
Grin2aP35436 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
Grin2aP35436 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
Grin2aP35436 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
Grin2aP35436 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
Grin2aP35436 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Grin2aP35436 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Grin2aP35436 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Grin2aP35436 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Grin2aP35436 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Grin2aP35436 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Grin2aP35436 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Grin2aP35436 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Grin2aP35436 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Grin2aP35436 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Grin2aP35436 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
Grin2aP35436 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Grin2aP35436 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Grin2aP35436 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
Grin2aP35436 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Grin2aP35436 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Grin2aP35436 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Grin2aP35436 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Grin2aP35436 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
Grin2aP35436 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Grin2aP35436 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Grin2aP35436 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Grin2aP35436 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Grin2aP35436 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Grin2aP35436 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Grin2aP35436 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
Grin2aP35436 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Grin2aP35436 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
Grin2aP35436 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Grin2aP35436 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Grin2aP35436 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Grin2aP35436 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
Grin2aP35436 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Grin2aP35436 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Grin2aP35436 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Grin2aP35436 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Grin2aP35436 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Grin2aP35436 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Grin2aP35436 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Grin2aP35436 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Grin2aP35436 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Grin2aP35436 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Grin2aP35436 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Grin2aP35436 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Grin2aP35436 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
Grin2aP35436 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Grin2aP35436 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.82
Grin2aP35436 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
Grin2aP35436 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
Grin2aP35436 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Grin2aP35436 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Grin2aP35436 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Grin2aP35436 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
Grin2aP35436 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Grin2aP35436 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Grin2aP35436 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Grin2aP35436 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
Grin2aP35436 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
Grin2aP35436 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
Grin2aP35436 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
Grin2aP35436 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Grin2aP35436 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Grin2aP35436 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Grin2aP35436 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Grin2aP35436 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Grin2aP35436 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Grin2aP35436 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Grin2aP35436 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
Grin2aP35436 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
Grin2aP35436 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
Grin2aP35436 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Grin2aP35436 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Grin2aP35436 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Grin2aP35436 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Grin2aP35436 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Grin2aP35436 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
Grin2aP35436 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Grin2aP35436 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
Grin2aP35436 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms