Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Prim2P33610 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prim2P33610 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prim2P33610 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prim2P33610 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prim2P33610 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Prim2P33610 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prim2P33610 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Prim2P33610 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prim2P33610 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prim2P33610 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prim2P33610 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prim2P33610 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prim2P33610 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prim2P33610 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prim2P33610 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prim2P33610 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prim2P33610 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prim2P33610 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prim2P33610 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prim2P33610 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prim2P33610 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prim2P33610 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prim2P33610 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prim2P33610 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prim2P33610 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prim2P33610 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prim2P33610 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prim2P33610 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prim2P33610 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prim2P33610 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prim2P33610 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prim2P33610 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prim2P33610 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prim2P33610 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prim2P33610 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prim2P33610 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prim2P33610 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prim2P33610 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prim2P33610 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prim2P33610 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prim2P33610 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Prim2P33610 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prim2P33610 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prim2P33610 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prim2P33610 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prim2P33610 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prim2P33610 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prim2P33610 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prim2P33610 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prim2P33610 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prim2P33610 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prim2P33610 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prim2P33610 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prim2P33610 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prim2P33610 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prim2P33610 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prim2P33610 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prim2P33610 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prim2P33610 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prim2P33610 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prim2P33610 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prim2P33610 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prim2P33610 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prim2P33610 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prim2P33610 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prim2P33610 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prim2P33610 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prim2P33610 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prim2P33610 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prim2P33610 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prim2P33610 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prim2P33610 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prim2P33610 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prim2P33610 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prim2P33610 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prim2P33610 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prim2P33610 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prim2P33610 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prim2P33610 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prim2P33610 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prim2P33610 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prim2P33610 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Prim2P33610 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prim2P33610 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prim2P33610 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prim2P33610 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prim2P33610 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prim2P33610 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prim2P33610 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Prim2P33610 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prim2P33610 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prim2P33610 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prim2P33610 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prim2P33610 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prim2P33610 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prim2P33610 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prim2P33610 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prim2P33610 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prim2P33610 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms