Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PtprmP28828 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PtprmP28828 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PtprmP28828 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PtprmP28828 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PtprmP28828 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
PtprmP28828 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PtprmP28828 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PtprmP28828 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PtprmP28828 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
PtprmP28828 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PtprmP28828 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PtprmP28828 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
PtprmP28828 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PtprmP28828 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PtprmP28828 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PtprmP28828 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PtprmP28828 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PtprmP28828 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PtprmP28828 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PtprmP28828 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PtprmP28828 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PtprmP28828 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PtprmP28828 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
PtprmP28828 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PtprmP28828 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PtprmP28828 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
PtprmP28828 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PtprmP28828 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PtprmP28828 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PtprmP28828 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PtprmP28828 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PtprmP28828 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
PtprmP28828 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PtprmP28828 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
PtprmP28828 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PtprmP28828 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PtprmP28828 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PtprmP28828 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PtprmP28828 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PtprmP28828 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PtprmP28828 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
PtprmP28828 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PtprmP28828 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PtprmP28828 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PtprmP28828 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PtprmP28828 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PtprmP28828 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PtprmP28828 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PtprmP28828 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PtprmP28828 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PtprmP28828 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PtprmP28828 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PtprmP28828 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
PtprmP28828 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PtprmP28828 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PtprmP28828 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PtprmP28828 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PtprmP28828 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PtprmP28828 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
PtprmP28828 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PtprmP28828 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PtprmP28828 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PtprmP28828 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PtprmP28828 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PtprmP28828 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PtprmP28828 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PtprmP28828 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PtprmP28828 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PtprmP28828 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PtprmP28828 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PtprmP28828 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PtprmP28828 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PtprmP28828 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PtprmP28828 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PtprmP28828 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PtprmP28828 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PtprmP28828 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
PtprmP28828 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PtprmP28828 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PtprmP28828 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PtprmP28828 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PtprmP28828 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PtprmP28828 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PtprmP28828 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PtprmP28828 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PtprmP28828 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
PtprmP28828 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
PtprmP28828 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
PtprmP28828 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PtprmP28828 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PtprmP28828 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
PtprmP28828 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PtprmP28828 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PtprmP28828 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PtprmP28828 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PtprmP28828 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PtprmP28828 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PtprmP28828 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PtprmP28828 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
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