Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LoxP28301 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LoxP28301 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LoxP28301 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LoxP28301 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LoxP28301 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LoxP28301 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LoxP28301 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LoxP28301 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LoxP28301 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LoxP28301 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LoxP28301 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LoxP28301 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LoxP28301 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LoxP28301 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LoxP28301 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LoxP28301 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LoxP28301 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LoxP28301 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LoxP28301 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LoxP28301 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LoxP28301 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LoxP28301 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LoxP28301 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LoxP28301 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LoxP28301 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LoxP28301 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LoxP28301 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LoxP28301 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LoxP28301 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LoxP28301 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LoxP28301 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LoxP28301 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LoxP28301 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LoxP28301 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LoxP28301 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LoxP28301 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LoxP28301 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LoxP28301 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LoxP28301 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LoxP28301 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LoxP28301 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LoxP28301 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LoxP28301 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LoxP28301 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LoxP28301 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LoxP28301 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LoxP28301 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LoxP28301 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LoxP28301 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LoxP28301 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LoxP28301 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LoxP28301 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LoxP28301 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LoxP28301 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LoxP28301 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LoxP28301 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LoxP28301 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LoxP28301 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LoxP28301 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LoxP28301 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LoxP28301 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LoxP28301 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LoxP28301 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LoxP28301 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LoxP28301 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LoxP28301 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LoxP28301 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LoxP28301 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LoxP28301 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LoxP28301 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LoxP28301 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LoxP28301 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LoxP28301 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LoxP28301 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LoxP28301 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LoxP28301 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LoxP28301 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LoxP28301 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LoxP28301 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LoxP28301 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LoxP28301 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LoxP28301 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LoxP28301 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LoxP28301 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LoxP28301 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LoxP28301 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LoxP28301 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LoxP28301 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LoxP28301 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LoxP28301 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LoxP28301 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LoxP28301 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LoxP28301 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LoxP28301 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LoxP28301 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LoxP28301 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LoxP28301 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LoxP28301 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LoxP28301 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms