Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nfkb1P25799 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nfkb1P25799 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nfkb1P25799 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nfkb1P25799 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nfkb1P25799 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nfkb1P25799 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nfkb1P25799 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nfkb1P25799 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nfkb1P25799 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nfkb1P25799 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Nfkb1P25799 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nfkb1P25799 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Nfkb1P25799 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nfkb1P25799 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nfkb1P25799 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nfkb1P25799 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nfkb1P25799 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nfkb1P25799 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nfkb1P25799 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nfkb1P25799 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nfkb1P25799 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nfkb1P25799 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nfkb1P25799 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nfkb1P25799 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nfkb1P25799 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nfkb1P25799 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nfkb1P25799 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nfkb1P25799 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nfkb1P25799 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nfkb1P25799 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nfkb1P25799 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nfkb1P25799 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nfkb1P25799 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nfkb1P25799 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nfkb1P25799 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nfkb1P25799 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nfkb1P25799 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nfkb1P25799 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nfkb1P25799 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nfkb1P25799 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nfkb1P25799 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Nfkb1P25799 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nfkb1P25799 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nfkb1P25799 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nfkb1P25799 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nfkb1P25799 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nfkb1P25799 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nfkb1P25799 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nfkb1P25799 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nfkb1P25799 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nfkb1P25799 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nfkb1P25799 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nfkb1P25799 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nfkb1P25799 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nfkb1P25799 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nfkb1P25799 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nfkb1P25799 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nfkb1P25799 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nfkb1P25799 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Nfkb1P25799 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nfkb1P25799 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nfkb1P25799 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nfkb1P25799 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nfkb1P25799 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nfkb1P25799 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nfkb1P25799 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nfkb1P25799 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nfkb1P25799 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nfkb1P25799 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nfkb1P25799 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nfkb1P25799 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nfkb1P25799 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nfkb1P25799 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nfkb1P25799 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nfkb1P25799 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nfkb1P25799 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nfkb1P25799 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nfkb1P25799 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nfkb1P25799 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nfkb1P25799 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nfkb1P25799 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nfkb1P25799 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nfkb1P25799 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nfkb1P25799 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nfkb1P25799 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nfkb1P25799 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nfkb1P25799 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nfkb1P25799 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nfkb1P25799 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nfkb1P25799 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nfkb1P25799 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nfkb1P25799 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nfkb1P25799 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nfkb1P25799 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nfkb1P25799 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nfkb1P25799 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfkb1P25799 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfkb1P25799 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nfkb1P25799 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms