Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Hoxd11P23813 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Hoxd11P23813 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Hoxd11P23813 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Hoxd11P23813 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Hoxd11P23813 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Hoxd11P23813 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28,74■■■□□ 2,19
Hoxd11P23813 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Hoxd11P23813 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Hoxd11P23813 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Hoxd11P23813 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28,73■■■□□ 2,19
Hoxd11P23813 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC28,73■■■□□ 2,19
Hoxd11P23813 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28,73■■■□□ 2,19
Hoxd11P23813 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Hoxd11P23813 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Hoxd11P23813 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28,71■■■□□ 2,19
Hoxd11P23813 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Hoxd11P23813 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Hoxd11P23813 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Hoxd11P23813 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,7■■■□□ 2,19
Hoxd11P23813 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Hoxd11P23813 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Hoxd11P23813 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Hoxd11P23813 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Hoxd11P23813 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC28,69■■■□□ 2,18
Hoxd11P23813 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Hoxd11P23813 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28,68■■■□□ 2,18
Hoxd11P23813 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28,68■■■□□ 2,18
Hoxd11P23813 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Hoxd11P23813 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Hoxd11P23813 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Hoxd11P23813 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Hoxd11P23813 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Hoxd11P23813 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28,64■■■□□ 2,18
Hoxd11P23813 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Hoxd11P23813 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Hoxd11P23813 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Hoxd11P23813 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC28,63■■■□□ 2,17
Hoxd11P23813 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Hoxd11P23813 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Hoxd11P23813 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Hoxd11P23813 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Hoxd11P23813 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Hoxd11P23813 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Hoxd11P23813 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28,58■■■□□ 2,17
Hoxd11P23813 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Hoxd11P23813 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Hoxd11P23813 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Hoxd11P23813 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Hoxd11P23813 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Hoxd11P23813 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Hoxd11P23813 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC28,55■■■□□ 2,16
Hoxd11P23813 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Hoxd11P23813 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Hoxd11P23813 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Hoxd11P23813 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Hoxd11P23813 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28,53■■■□□ 2,16
Hoxd11P23813 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28,53■■■□□ 2,16
Hoxd11P23813 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Hoxd11P23813 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Hoxd11P23813 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Hoxd11P23813 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Hoxd11P23813 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Hoxd11P23813 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Hoxd11P23813 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC28,48■■■□□ 2,15
Hoxd11P23813 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Hoxd11P23813 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28,48■■■□□ 2,15
Hoxd11P23813 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Hoxd11P23813 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Hoxd11P23813 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28,47■■■□□ 2,15
Hoxd11P23813 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Hoxd11P23813 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Hoxd11P23813 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Hoxd11P23813 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC28,45■■■□□ 2,14
Hoxd11P23813 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28,45■■■□□ 2,14
Hoxd11P23813 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Hoxd11P23813 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Hoxd11P23813 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Hoxd11P23813 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Hoxd11P23813 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Hoxd11P23813 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Hoxd11P23813 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Hoxd11P23813 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28,39■■■□□ 2,14
Hoxd11P23813 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Hoxd11P23813 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Hoxd11P23813 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Hoxd11P23813 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Hoxd11P23813 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Hoxd11P23813 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Hoxd11P23813 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Hoxd11P23813 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Hoxd11P23813 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28,35■■■□□ 2,13
Hoxd11P23813 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Hoxd11P23813 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Hoxd11P23813 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Hoxd11P23813 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
Hoxd11P23813 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Hoxd11P23813 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Hoxd11P23813 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Hoxd11P23813 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,2 ms