Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bmp4P21275 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bmp4P21275 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bmp4P21275 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bmp4P21275 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bmp4P21275 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bmp4P21275 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bmp4P21275 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bmp4P21275 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bmp4P21275 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bmp4P21275 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bmp4P21275 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bmp4P21275 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Bmp4P21275 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Bmp4P21275 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bmp4P21275 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bmp4P21275 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bmp4P21275 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bmp4P21275 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bmp4P21275 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bmp4P21275 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bmp4P21275 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bmp4P21275 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bmp4P21275 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bmp4P21275 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bmp4P21275 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bmp4P21275 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bmp4P21275 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bmp4P21275 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bmp4P21275 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bmp4P21275 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bmp4P21275 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bmp4P21275 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bmp4P21275 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bmp4P21275 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bmp4P21275 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Bmp4P21275 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bmp4P21275 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bmp4P21275 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bmp4P21275 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bmp4P21275 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bmp4P21275 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bmp4P21275 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bmp4P21275 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bmp4P21275 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bmp4P21275 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bmp4P21275 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Bmp4P21275 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bmp4P21275 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bmp4P21275 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bmp4P21275 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bmp4P21275 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bmp4P21275 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bmp4P21275 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bmp4P21275 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bmp4P21275 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bmp4P21275 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bmp4P21275 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bmp4P21275 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bmp4P21275 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bmp4P21275 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bmp4P21275 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bmp4P21275 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bmp4P21275 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bmp4P21275 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bmp4P21275 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bmp4P21275 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bmp4P21275 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bmp4P21275 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bmp4P21275 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bmp4P21275 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bmp4P21275 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bmp4P21275 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bmp4P21275 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bmp4P21275 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bmp4P21275 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bmp4P21275 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bmp4P21275 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bmp4P21275 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bmp4P21275 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bmp4P21275 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bmp4P21275 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bmp4P21275 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bmp4P21275 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bmp4P21275 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bmp4P21275 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bmp4P21275 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bmp4P21275 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bmp4P21275 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bmp4P21275 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bmp4P21275 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bmp4P21275 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bmp4P21275 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bmp4P21275 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bmp4P21275 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bmp4P21275 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Bmp4P21275 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bmp4P21275 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bmp4P21275 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bmp4P21275 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms