Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PdgfaP20033 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PdgfaP20033 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PdgfaP20033 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PdgfaP20033 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PdgfaP20033 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PdgfaP20033 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PdgfaP20033 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdgfaP20033 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdgfaP20033 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdgfaP20033 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdgfaP20033 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdgfaP20033 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdgfaP20033 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PdgfaP20033 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PdgfaP20033 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfaP20033 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfaP20033 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfaP20033 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfaP20033 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfaP20033 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfaP20033 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfaP20033 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PdgfaP20033 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PdgfaP20033 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PdgfaP20033 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PdgfaP20033 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PdgfaP20033 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PdgfaP20033 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PdgfaP20033 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdgfaP20033 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdgfaP20033 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdgfaP20033 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PdgfaP20033 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PdgfaP20033 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PdgfaP20033 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PdgfaP20033 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PdgfaP20033 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PdgfaP20033 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PdgfaP20033 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PdgfaP20033 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PdgfaP20033 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdgfaP20033 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdgfaP20033 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdgfaP20033 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdgfaP20033 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdgfaP20033 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PdgfaP20033 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdgfaP20033 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdgfaP20033 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdgfaP20033 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PdgfaP20033 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PdgfaP20033 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PdgfaP20033 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PdgfaP20033 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PdgfaP20033 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PdgfaP20033 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PdgfaP20033 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PdgfaP20033 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PdgfaP20033 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PdgfaP20033 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PdgfaP20033 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PdgfaP20033 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PdgfaP20033 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdgfaP20033 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdgfaP20033 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PdgfaP20033 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PdgfaP20033 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdgfaP20033 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdgfaP20033 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PdgfaP20033 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdgfaP20033 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PdgfaP20033 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdgfaP20033 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PdgfaP20033 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdgfaP20033 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdgfaP20033 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PdgfaP20033 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdgfaP20033 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdgfaP20033 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdgfaP20033 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfaP20033 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfaP20033 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfaP20033 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfaP20033 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdgfaP20033 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdgfaP20033 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdgfaP20033 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdgfaP20033 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdgfaP20033 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdgfaP20033 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfaP20033 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfaP20033 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfaP20033 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfaP20033 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfaP20033 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfaP20033 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfaP20033 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdgfaP20033 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdgfaP20033 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms