Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NefhP19246 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NefhP19246 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NefhP19246 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NefhP19246 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NefhP19246 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NefhP19246 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NefhP19246 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NefhP19246 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NefhP19246 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NefhP19246 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NefhP19246 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NefhP19246 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NefhP19246 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NefhP19246 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NefhP19246 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NefhP19246 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NefhP19246 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NefhP19246 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NefhP19246 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NefhP19246 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NefhP19246 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NefhP19246 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NefhP19246 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NefhP19246 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NefhP19246 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NefhP19246 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NefhP19246 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NefhP19246 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NefhP19246 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NefhP19246 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NefhP19246 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NefhP19246 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NefhP19246 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NefhP19246 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NefhP19246 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NefhP19246 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NefhP19246 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NefhP19246 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NefhP19246 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NefhP19246 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NefhP19246 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NefhP19246 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NefhP19246 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NefhP19246 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NefhP19246 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NefhP19246 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NefhP19246 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NefhP19246 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NefhP19246 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NefhP19246 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NefhP19246 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NefhP19246 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NefhP19246 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NefhP19246 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NefhP19246 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NefhP19246 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NefhP19246 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NefhP19246 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NefhP19246 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NefhP19246 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NefhP19246 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NefhP19246 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NefhP19246 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NefhP19246 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NefhP19246 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NefhP19246 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NefhP19246 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NefhP19246 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NefhP19246 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NefhP19246 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NefhP19246 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NefhP19246 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NefhP19246 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NefhP19246 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NefhP19246 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NefhP19246 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NefhP19246 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NefhP19246 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NefhP19246 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NefhP19246 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NefhP19246 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NefhP19246 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NefhP19246 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NefhP19246 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NefhP19246 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NefhP19246 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NefhP19246 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NefhP19246 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NefhP19246 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NefhP19246 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NefhP19246 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NefhP19246 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NefhP19246 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NefhP19246 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NefhP19246 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NefhP19246 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NefhP19246 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NefhP19246 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NefhP19246 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms