Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sptan1P16546 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sptan1P16546 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sptan1P16546 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sptan1P16546 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sptan1P16546 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sptan1P16546 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sptan1P16546 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sptan1P16546 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sptan1P16546 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sptan1P16546 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sptan1P16546 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sptan1P16546 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sptan1P16546 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sptan1P16546 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sptan1P16546 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sptan1P16546 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sptan1P16546 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sptan1P16546 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sptan1P16546 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sptan1P16546 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sptan1P16546 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sptan1P16546 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sptan1P16546 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sptan1P16546 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sptan1P16546 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sptan1P16546 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sptan1P16546 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sptan1P16546 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sptan1P16546 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sptan1P16546 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sptan1P16546 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sptan1P16546 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sptan1P16546 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sptan1P16546 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sptan1P16546 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sptan1P16546 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sptan1P16546 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sptan1P16546 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sptan1P16546 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sptan1P16546 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sptan1P16546 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sptan1P16546 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sptan1P16546 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sptan1P16546 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sptan1P16546 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sptan1P16546 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sptan1P16546 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sptan1P16546 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sptan1P16546 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Sptan1P16546 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sptan1P16546 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sptan1P16546 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sptan1P16546 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sptan1P16546 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sptan1P16546 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sptan1P16546 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sptan1P16546 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sptan1P16546 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sptan1P16546 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Sptan1P16546 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sptan1P16546 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sptan1P16546 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sptan1P16546 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sptan1P16546 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Sptan1P16546 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sptan1P16546 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Sptan1P16546 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sptan1P16546 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sptan1P16546 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sptan1P16546 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sptan1P16546 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sptan1P16546 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sptan1P16546 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sptan1P16546 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sptan1P16546 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Sptan1P16546 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sptan1P16546 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sptan1P16546 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sptan1P16546 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sptan1P16546 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sptan1P16546 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sptan1P16546 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sptan1P16546 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sptan1P16546 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sptan1P16546 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sptan1P16546 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sptan1P16546 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sptan1P16546 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sptan1P16546 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sptan1P16546 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sptan1P16546 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sptan1P16546 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sptan1P16546 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sptan1P16546 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sptan1P16546 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sptan1P16546 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sptan1P16546 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sptan1P16546 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sptan1P16546 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms