Protein–RNA interactions for Protein: P0C7N9

Psmg4, Proteasome assembly chaperone 4, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmg4P0C7N9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmg4P0C7N9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmg4P0C7N9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmg4P0C7N9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmg4P0C7N9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmg4P0C7N9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmg4P0C7N9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmg4P0C7N9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmg4P0C7N9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmg4P0C7N9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmg4P0C7N9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmg4P0C7N9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmg4P0C7N9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmg4P0C7N9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmg4P0C7N9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmg4P0C7N9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmg4P0C7N9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmg4P0C7N9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmg4P0C7N9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmg4P0C7N9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmg4P0C7N9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmg4P0C7N9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmg4P0C7N9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmg4P0C7N9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmg4P0C7N9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmg4P0C7N9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmg4P0C7N9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmg4P0C7N9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmg4P0C7N9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmg4P0C7N9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmg4P0C7N9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmg4P0C7N9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg4P0C7N9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg4P0C7N9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg4P0C7N9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg4P0C7N9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmg4P0C7N9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmg4P0C7N9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmg4P0C7N9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmg4P0C7N9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmg4P0C7N9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmg4P0C7N9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmg4P0C7N9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmg4P0C7N9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmg4P0C7N9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmg4P0C7N9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmg4P0C7N9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmg4P0C7N9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmg4P0C7N9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmg4P0C7N9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmg4P0C7N9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmg4P0C7N9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmg4P0C7N9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmg4P0C7N9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmg4P0C7N9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmg4P0C7N9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmg4P0C7N9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmg4P0C7N9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmg4P0C7N9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psmg4P0C7N9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmg4P0C7N9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmg4P0C7N9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmg4P0C7N9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmg4P0C7N9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psmg4P0C7N9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms