Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtrP07309 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtrP07309 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TtrP07309 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtrP07309 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtrP07309 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtrP07309 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtrP07309 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TtrP07309 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TtrP07309 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtrP07309 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtrP07309 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtrP07309 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtrP07309 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtrP07309 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TtrP07309 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TtrP07309 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TtrP07309 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TtrP07309 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TtrP07309 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TtrP07309 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TtrP07309 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TtrP07309 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TtrP07309 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TtrP07309 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TtrP07309 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TtrP07309 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TtrP07309 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TtrP07309 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TtrP07309 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TtrP07309 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TtrP07309 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TtrP07309 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TtrP07309 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TtrP07309 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TtrP07309 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TtrP07309 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TtrP07309 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TtrP07309 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TtrP07309 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TtrP07309 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TtrP07309 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtrP07309 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtrP07309 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtrP07309 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtrP07309 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtrP07309 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TtrP07309 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtrP07309 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtrP07309 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TtrP07309 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtrP07309 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtrP07309 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TtrP07309 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TtrP07309 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TtrP07309 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TtrP07309 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtrP07309 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtrP07309 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TtrP07309 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TtrP07309 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TtrP07309 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TtrP07309 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TtrP07309 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TtrP07309 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TtrP07309 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtrP07309 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtrP07309 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TtrP07309 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtrP07309 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TtrP07309 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TtrP07309 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TtrP07309 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TtrP07309 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TtrP07309 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TtrP07309 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TtrP07309 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TtrP07309 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TtrP07309 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TtrP07309 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TtrP07309 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TtrP07309 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TtrP07309 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TtrP07309 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TtrP07309 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TtrP07309 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TtrP07309 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TtrP07309 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TtrP07309 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TtrP07309 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TtrP07309 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TtrP07309 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TtrP07309 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TtrP07309 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TtrP07309 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TtrP07309 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TtrP07309 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TtrP07309 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TtrP07309 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TtrP07309 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms