Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ItgamP05555 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ItgamP05555 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ItgamP05555 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ItgamP05555 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ItgamP05555 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ItgamP05555 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ItgamP05555 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ItgamP05555 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ItgamP05555 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ItgamP05555 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ItgamP05555 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ItgamP05555 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ItgamP05555 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ItgamP05555 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ItgamP05555 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ItgamP05555 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ItgamP05555 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ItgamP05555 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ItgamP05555 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ItgamP05555 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ItgamP05555 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ItgamP05555 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ItgamP05555 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ItgamP05555 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ItgamP05555 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ItgamP05555 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ItgamP05555 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ItgamP05555 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ItgamP05555 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ItgamP05555 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ItgamP05555 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ItgamP05555 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ItgamP05555 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ItgamP05555 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ItgamP05555 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ItgamP05555 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ItgamP05555 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ItgamP05555 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ItgamP05555 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ItgamP05555 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ItgamP05555 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ItgamP05555 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ItgamP05555 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ItgamP05555 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ItgamP05555 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ItgamP05555 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ItgamP05555 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ItgamP05555 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ItgamP05555 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ItgamP05555 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ItgamP05555 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ItgamP05555 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ItgamP05555 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ItgamP05555 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ItgamP05555 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ItgamP05555 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ItgamP05555 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ItgamP05555 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ItgamP05555 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ItgamP05555 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ItgamP05555 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ItgamP05555 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ItgamP05555 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ItgamP05555 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ItgamP05555 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ItgamP05555 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ItgamP05555 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ItgamP05555 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ItgamP05555 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ItgamP05555 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ItgamP05555 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ItgamP05555 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ItgamP05555 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItgamP05555 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItgamP05555 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItgamP05555 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItgamP05555 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItgamP05555 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItgamP05555 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItgamP05555 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItgamP05555 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItgamP05555 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItgamP05555 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItgamP05555 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ItgamP05555 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItgamP05555 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItgamP05555 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItgamP05555 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItgamP05555 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgamP05555 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ItgamP05555 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ItgamP05555 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ItgamP05555 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ItgamP05555 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ItgamP05555 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ItgamP05555 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ItgamP05555 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ItgamP05555 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ItgamP05555 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms