Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hoxa7P02830 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Hoxa7P02830 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Hoxa7P02830 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Hoxa7P02830 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Hoxa7P02830 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Hoxa7P02830 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Hoxa7P02830 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hoxa7P02830 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hoxa7P02830 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hoxa7P02830 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hoxa7P02830 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hoxa7P02830 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hoxa7P02830 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hoxa7P02830 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hoxa7P02830 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hoxa7P02830 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hoxa7P02830 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hoxa7P02830 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hoxa7P02830 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hoxa7P02830 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hoxa7P02830 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hoxa7P02830 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hoxa7P02830 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hoxa7P02830 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hoxa7P02830 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hoxa7P02830 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hoxa7P02830 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hoxa7P02830 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hoxa7P02830 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hoxa7P02830 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hoxa7P02830 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hoxa7P02830 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hoxa7P02830 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hoxa7P02830 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hoxa7P02830 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hoxa7P02830 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hoxa7P02830 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Hoxa7P02830 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hoxa7P02830 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hoxa7P02830 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hoxa7P02830 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hoxa7P02830 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hoxa7P02830 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hoxa7P02830 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hoxa7P02830 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hoxa7P02830 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hoxa7P02830 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hoxa7P02830 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hoxa7P02830 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hoxa7P02830 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hoxa7P02830 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Hoxa7P02830 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hoxa7P02830 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hoxa7P02830 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hoxa7P02830 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hoxa7P02830 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hoxa7P02830 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hoxa7P02830 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hoxa7P02830 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hoxa7P02830 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hoxa7P02830 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hoxa7P02830 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hoxa7P02830 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hoxa7P02830 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Hoxa7P02830 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Hoxa7P02830 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Hoxa7P02830 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Hoxa7P02830 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hoxa7P02830 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hoxa7P02830 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hoxa7P02830 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hoxa7P02830 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hoxa7P02830 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hoxa7P02830 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hoxa7P02830 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hoxa7P02830 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hoxa7P02830 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hoxa7P02830 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hoxa7P02830 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hoxa7P02830 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hoxa7P02830 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hoxa7P02830 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hoxa7P02830 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hoxa7P02830 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Hoxa7P02830 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hoxa7P02830 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hoxa7P02830 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hoxa7P02830 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hoxa7P02830 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hoxa7P02830 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Hoxa7P02830 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hoxa7P02830 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hoxa7P02830 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Hoxa7P02830 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hoxa7P02830 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hoxa7P02830 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Hoxa7P02830 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hoxa7P02830 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Hoxa7P02830 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms