Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Lamc1P02468 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Lamc1P02468 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Lamc1P02468 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Lamc1P02468 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Lamc1P02468 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Lamc1P02468 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Lamc1P02468 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Lamc1P02468 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Lamc1P02468 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Lamc1P02468 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Lamc1P02468 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Lamc1P02468 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Lamc1P02468 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Lamc1P02468 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Lamc1P02468 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Lamc1P02468 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Lamc1P02468 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Lamc1P02468 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Lamc1P02468 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Lamc1P02468 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Lamc1P02468 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Lamc1P02468 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Lamc1P02468 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Lamc1P02468 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Lamc1P02468 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Lamc1P02468 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Lamc1P02468 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Lamc1P02468 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Lamc1P02468 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Lamc1P02468 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Lamc1P02468 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Lamc1P02468 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Lamc1P02468 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Lamc1P02468 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Lamc1P02468 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Lamc1P02468 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Lamc1P02468 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Lamc1P02468 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Lamc1P02468 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Lamc1P02468 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Lamc1P02468 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Lamc1P02468 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Lamc1P02468 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Lamc1P02468 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Lamc1P02468 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Lamc1P02468 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Lamc1P02468 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Lamc1P02468 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Lamc1P02468 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Lamc1P02468 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Lamc1P02468 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Lamc1P02468 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Lamc1P02468 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Lamc1P02468 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Lamc1P02468 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Lamc1P02468 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Lamc1P02468 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Lamc1P02468 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Lamc1P02468 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Lamc1P02468 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Lamc1P02468 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Lamc1P02468 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Lamc1P02468 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Lamc1P02468 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Lamc1P02468 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Lamc1P02468 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Lamc1P02468 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Lamc1P02468 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Lamc1P02468 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Lamc1P02468 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Lamc1P02468 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Lamc1P02468 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Lamc1P02468 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Lamc1P02468 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Lamc1P02468 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Lamc1P02468 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Lamc1P02468 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Lamc1P02468 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Lamc1P02468 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Lamc1P02468 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Lamc1P02468 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Lamc1P02468 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Lamc1P02468 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Lamc1P02468 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Lamc1P02468 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Lamc1P02468 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Lamc1P02468 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Lamc1P02468 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Lamc1P02468 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Lamc1P02468 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Lamc1P02468 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Lamc1P02468 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Lamc1P02468 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Lamc1P02468 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Lamc1P02468 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Lamc1P02468 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Lamc1P02468 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Lamc1P02468 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Lamc1P02468 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms