Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
P01672 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
P01672 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01672 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01672 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01672 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01672 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01672 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01672 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01672 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01672 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01672 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01672 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01672 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01672 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01672 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01672 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01672 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01672 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01672 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01672 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01672 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01672 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01672 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01672 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01672 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01672 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01672 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
P01672 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01672 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01672 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
P01672 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01672 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01672 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01672 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01672 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01672 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01672 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01672 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01672 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01672 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01672 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
P01672 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01672 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01672 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01672 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01672 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01672 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01672 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01672 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01672 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01672 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01672 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01672 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
P01672 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
P01672 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
P01672 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01672 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01672 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01672 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01672 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01672 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01672 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01672 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01672 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01672 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01672 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
P01672 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01672 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
P01672 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01672 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
P01672 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01672 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01672 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01672 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01672 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
P01672 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
P01672 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
P01672 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01672 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01672 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01672 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P01672 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01672 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01672 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01672 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
P01672 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
P01672 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01672 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01672 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P01672 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01672 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01672 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
P01672 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01672 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
P01672 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01672 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01672 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01672 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
P01672 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms