Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F11rO88792 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
F11rO88792 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F11rO88792 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F11rO88792 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
F11rO88792 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
F11rO88792 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
F11rO88792 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
F11rO88792 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
F11rO88792 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
F11rO88792 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
F11rO88792 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
F11rO88792 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
F11rO88792 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
F11rO88792 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
F11rO88792 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
F11rO88792 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
F11rO88792 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
F11rO88792 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
F11rO88792 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F11rO88792 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
F11rO88792 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
F11rO88792 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F11rO88792 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
F11rO88792 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
F11rO88792 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F11rO88792 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F11rO88792 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F11rO88792 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F11rO88792 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F11rO88792 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F11rO88792 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
F11rO88792 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F11rO88792 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F11rO88792 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F11rO88792 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
F11rO88792 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F11rO88792 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
F11rO88792 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
F11rO88792 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
F11rO88792 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
F11rO88792 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
F11rO88792 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F11rO88792 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
F11rO88792 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
F11rO88792 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F11rO88792 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F11rO88792 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F11rO88792 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
F11rO88792 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F11rO88792 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F11rO88792 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
F11rO88792 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
F11rO88792 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
F11rO88792 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
F11rO88792 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
F11rO88792 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
F11rO88792 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
F11rO88792 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
F11rO88792 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
F11rO88792 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F11rO88792 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F11rO88792 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F11rO88792 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F11rO88792 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
F11rO88792 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
F11rO88792 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
F11rO88792 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
F11rO88792 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
F11rO88792 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
F11rO88792 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
F11rO88792 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
F11rO88792 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
F11rO88792 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F11rO88792 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
F11rO88792 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
F11rO88792 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F11rO88792 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
F11rO88792 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F11rO88792 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
F11rO88792 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
F11rO88792 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
F11rO88792 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
F11rO88792 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
F11rO88792 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
F11rO88792 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F11rO88792 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F11rO88792 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F11rO88792 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
F11rO88792 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
F11rO88792 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
F11rO88792 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
F11rO88792 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
F11rO88792 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
F11rO88792 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
F11rO88792 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F11rO88792 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
F11rO88792 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F11rO88792 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
F11rO88792 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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