Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Parp2O88554 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Parp2O88554 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Parp2O88554 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Parp2O88554 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Parp2O88554 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Parp2O88554 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Parp2O88554 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Parp2O88554 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Parp2O88554 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Parp2O88554 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Parp2O88554 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Parp2O88554 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Parp2O88554 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Parp2O88554 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Parp2O88554 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Parp2O88554 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Parp2O88554 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Parp2O88554 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Parp2O88554 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Parp2O88554 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Parp2O88554 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Parp2O88554 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Parp2O88554 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Parp2O88554 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Parp2O88554 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Parp2O88554 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Parp2O88554 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Parp2O88554 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Parp2O88554 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Parp2O88554 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Parp2O88554 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Parp2O88554 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Parp2O88554 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Parp2O88554 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Parp2O88554 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Parp2O88554 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Parp2O88554 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Parp2O88554 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Parp2O88554 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Parp2O88554 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Parp2O88554 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Parp2O88554 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Parp2O88554 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Parp2O88554 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Parp2O88554 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Parp2O88554 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Parp2O88554 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Parp2O88554 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Parp2O88554 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Parp2O88554 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Parp2O88554 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Parp2O88554 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Parp2O88554 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Parp2O88554 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Parp2O88554 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Parp2O88554 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Parp2O88554 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Parp2O88554 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Parp2O88554 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Parp2O88554 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Parp2O88554 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Parp2O88554 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Parp2O88554 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Parp2O88554 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Parp2O88554 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Parp2O88554 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Parp2O88554 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Parp2O88554 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Parp2O88554 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Parp2O88554 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Parp2O88554 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Parp2O88554 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Parp2O88554 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Parp2O88554 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Parp2O88554 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Parp2O88554 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Parp2O88554 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Parp2O88554 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Parp2O88554 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Parp2O88554 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Parp2O88554 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Parp2O88554 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Parp2O88554 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Parp2O88554 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Parp2O88554 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Parp2O88554 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Parp2O88554 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Parp2O88554 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Parp2O88554 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Parp2O88554 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Parp2O88554 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Parp2O88554 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Parp2O88554 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Parp2O88554 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Parp2O88554 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Parp2O88554 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Parp2O88554 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Parp2O88554 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Parp2O88554 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms