Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srpk1O70551 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srpk1O70551 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srpk1O70551 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srpk1O70551 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srpk1O70551 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srpk1O70551 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srpk1O70551 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srpk1O70551 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srpk1O70551 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srpk1O70551 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srpk1O70551 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srpk1O70551 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srpk1O70551 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Srpk1O70551 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Srpk1O70551 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srpk1O70551 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srpk1O70551 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srpk1O70551 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srpk1O70551 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srpk1O70551 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srpk1O70551 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srpk1O70551 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srpk1O70551 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srpk1O70551 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srpk1O70551 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srpk1O70551 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srpk1O70551 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srpk1O70551 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srpk1O70551 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srpk1O70551 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srpk1O70551 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srpk1O70551 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Srpk1O70551 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srpk1O70551 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srpk1O70551 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srpk1O70551 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srpk1O70551 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srpk1O70551 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srpk1O70551 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srpk1O70551 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srpk1O70551 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srpk1O70551 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srpk1O70551 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srpk1O70551 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srpk1O70551 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srpk1O70551 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srpk1O70551 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Srpk1O70551 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srpk1O70551 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srpk1O70551 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srpk1O70551 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srpk1O70551 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srpk1O70551 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srpk1O70551 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srpk1O70551 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srpk1O70551 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srpk1O70551 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srpk1O70551 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srpk1O70551 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Srpk1O70551 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srpk1O70551 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srpk1O70551 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Srpk1O70551 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srpk1O70551 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srpk1O70551 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Srpk1O70551 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Srpk1O70551 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srpk1O70551 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srpk1O70551 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Srpk1O70551 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srpk1O70551 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srpk1O70551 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srpk1O70551 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Srpk1O70551 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srpk1O70551 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srpk1O70551 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Srpk1O70551 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srpk1O70551 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Srpk1O70551 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srpk1O70551 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srpk1O70551 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Srpk1O70551 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Srpk1O70551 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srpk1O70551 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Srpk1O70551 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srpk1O70551 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srpk1O70551 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srpk1O70551 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Srpk1O70551 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Srpk1O70551 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srpk1O70551 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Srpk1O70551 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srpk1O70551 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Srpk1O70551 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Srpk1O70551 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srpk1O70551 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srpk1O70551 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srpk1O70551 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Srpk1O70551 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms