Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Hcn4O70507 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Hcn4O70507 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Hcn4O70507 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Hcn4O70507 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Hcn4O70507 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25,72■■□□□ 1,71
Hcn4O70507 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Hcn4O70507 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Hcn4O70507 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Hcn4O70507 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Hcn4O70507 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Hcn4O70507 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Hcn4O70507 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Hcn4O70507 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Hcn4O70507 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Hcn4O70507 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Hcn4O70507 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Hcn4O70507 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Hcn4O70507 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25,64■■□□□ 1,7
Hcn4O70507 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Hcn4O70507 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Hcn4O70507 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Hcn4O70507 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25,62■■□□□ 1,69
Hcn4O70507 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Hcn4O70507 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Hcn4O70507 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Hcn4O70507 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Hcn4O70507 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Hcn4O70507 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Hcn4O70507 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Hcn4O70507 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Hcn4O70507 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Hcn4O70507 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Hcn4O70507 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Hcn4O70507 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Hcn4O70507 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Hcn4O70507 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Hcn4O70507 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Hcn4O70507 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Hcn4O70507 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Hcn4O70507 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25,5■■□□□ 1,67
Hcn4O70507 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25,5■■□□□ 1,67
Hcn4O70507 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Hcn4O70507 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
Hcn4O70507 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Hcn4O70507 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Hcn4O70507 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Hcn4O70507 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Hcn4O70507 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Hcn4O70507 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Hcn4O70507 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
Hcn4O70507 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Hcn4O70507 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Hcn4O70507 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Hcn4O70507 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Hcn4O70507 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Hcn4O70507 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Hcn4O70507 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Hcn4O70507 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Hcn4O70507 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Hcn4O70507 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Hcn4O70507 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Hcn4O70507 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25,43■■□□□ 1,66
Hcn4O70507 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Hcn4O70507 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Hcn4O70507 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Hcn4O70507 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Hcn4O70507 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Hcn4O70507 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Hcn4O70507 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Hcn4O70507 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Hcn4O70507 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Hcn4O70507 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Hcn4O70507 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Hcn4O70507 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25,39■■□□□ 1,66
Hcn4O70507 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Hcn4O70507 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Hcn4O70507 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Hcn4O70507 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Hcn4O70507 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Hcn4O70507 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Hcn4O70507 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Hcn4O70507 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Hcn4O70507 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25,36■■□□□ 1,65
Hcn4O70507 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Hcn4O70507 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Hcn4O70507 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Hcn4O70507 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25,34■■□□□ 1,65
Hcn4O70507 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Hcn4O70507 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25,33■■□□□ 1,65
Hcn4O70507 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,64
Hcn4O70507 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Hcn4O70507 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25,32■■□□□ 1,64
Hcn4O70507 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Hcn4O70507 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Hcn4O70507 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Hcn4O70507 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25,31■■□□□ 1,64
Hcn4O70507 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Hcn4O70507 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Hcn4O70507 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,7 ms