Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Nck2O55033 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Nck2O55033 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Nck2O55033 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nck2O55033 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nck2O55033 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Nck2O55033 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nck2O55033 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Nck2O55033 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nck2O55033 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nck2O55033 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nck2O55033 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nck2O55033 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nck2O55033 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nck2O55033 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nck2O55033 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nck2O55033 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nck2O55033 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nck2O55033 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nck2O55033 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nck2O55033 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nck2O55033 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nck2O55033 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nck2O55033 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nck2O55033 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nck2O55033 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nck2O55033 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nck2O55033 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nck2O55033 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nck2O55033 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nck2O55033 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nck2O55033 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nck2O55033 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Nck2O55033 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nck2O55033 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nck2O55033 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nck2O55033 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nck2O55033 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nck2O55033 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Nck2O55033 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Nck2O55033 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nck2O55033 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nck2O55033 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nck2O55033 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nck2O55033 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nck2O55033 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nck2O55033 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nck2O55033 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nck2O55033 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nck2O55033 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nck2O55033 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nck2O55033 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nck2O55033 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nck2O55033 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nck2O55033 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nck2O55033 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nck2O55033 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nck2O55033 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nck2O55033 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nck2O55033 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nck2O55033 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nck2O55033 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nck2O55033 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nck2O55033 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nck2O55033 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nck2O55033 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nck2O55033 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nck2O55033 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nck2O55033 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nck2O55033 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nck2O55033 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nck2O55033 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nck2O55033 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nck2O55033 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nck2O55033 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nck2O55033 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nck2O55033 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nck2O55033 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nck2O55033 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nck2O55033 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nck2O55033 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nck2O55033 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nck2O55033 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nck2O55033 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nck2O55033 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nck2O55033 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nck2O55033 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nck2O55033 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nck2O55033 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nck2O55033 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Nck2O55033 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nck2O55033 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nck2O55033 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Nck2O55033 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Nck2O55033 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Nck2O55033 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nck2O55033 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Nck2O55033 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Nck2O55033 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Nck2O55033 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms