Protein–RNA interactions for Protein: O54984

Asna1, ATPase Asna1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asna1O54984 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Asna1O54984 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Asna1O54984 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Asna1O54984 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Asna1O54984 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Asna1O54984 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Asna1O54984 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Asna1O54984 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Asna1O54984 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Asna1O54984 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Asna1O54984 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Asna1O54984 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Asna1O54984 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Asna1O54984 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Asna1O54984 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Asna1O54984 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Asna1O54984 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Asna1O54984 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Asna1O54984 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Asna1O54984 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Asna1O54984 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Asna1O54984 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Asna1O54984 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Asna1O54984 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Asna1O54984 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Asna1O54984 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Asna1O54984 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Asna1O54984 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Asna1O54984 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Asna1O54984 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Asna1O54984 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Asna1O54984 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Asna1O54984 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Asna1O54984 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Asna1O54984 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Asna1O54984 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Asna1O54984 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Asna1O54984 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Asna1O54984 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Asna1O54984 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Asna1O54984 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Asna1O54984 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Asna1O54984 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Asna1O54984 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Asna1O54984 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Asna1O54984 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Asna1O54984 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Asna1O54984 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Asna1O54984 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Asna1O54984 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Asna1O54984 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Asna1O54984 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Asna1O54984 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Asna1O54984 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Asna1O54984 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Asna1O54984 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Asna1O54984 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Asna1O54984 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Asna1O54984 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Asna1O54984 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Asna1O54984 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Asna1O54984 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Asna1O54984 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Asna1O54984 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Asna1O54984 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Asna1O54984 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Asna1O54984 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Asna1O54984 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Asna1O54984 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Asna1O54984 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Asna1O54984 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Asna1O54984 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Asna1O54984 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Asna1O54984 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Asna1O54984 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Asna1O54984 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Asna1O54984 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Asna1O54984 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Asna1O54984 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Asna1O54984 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Asna1O54984 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Asna1O54984 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Asna1O54984 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Asna1O54984 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Asna1O54984 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Asna1O54984 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Asna1O54984 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Asna1O54984 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Asna1O54984 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Asna1O54984 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Asna1O54984 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Asna1O54984 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Asna1O54984 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Asna1O54984 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Asna1O54984 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Asna1O54984 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Asna1O54984 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Asna1O54984 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Asna1O54984 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Asna1O54984 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms