Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Dnajb6O54946 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
Dnajb6O54946 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Dnajb6O54946 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Dnajb6O54946 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Dnajb6O54946 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Dnajb6O54946 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Dnajb6O54946 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Dnajb6O54946 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Dnajb6O54946 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Dnajb6O54946 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Dnajb6O54946 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Dnajb6O54946 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Dnajb6O54946 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Dnajb6O54946 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Dnajb6O54946 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Dnajb6O54946 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Dnajb6O54946 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Dnajb6O54946 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Dnajb6O54946 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Dnajb6O54946 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Dnajb6O54946 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Dnajb6O54946 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Dnajb6O54946 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Dnajb6O54946 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Dnajb6O54946 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Dnajb6O54946 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dnajb6O54946 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dnajb6O54946 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dnajb6O54946 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Dnajb6O54946 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Dnajb6O54946 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dnajb6O54946 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dnajb6O54946 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dnajb6O54946 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dnajb6O54946 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Dnajb6O54946 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Dnajb6O54946 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Dnajb6O54946 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Dnajb6O54946 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Dnajb6O54946 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dnajb6O54946 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dnajb6O54946 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dnajb6O54946 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dnajb6O54946 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dnajb6O54946 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dnajb6O54946 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dnajb6O54946 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Dnajb6O54946 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Dnajb6O54946 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Dnajb6O54946 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Dnajb6O54946 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dnajb6O54946 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Dnajb6O54946 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dnajb6O54946 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dnajb6O54946 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dnajb6O54946 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dnajb6O54946 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dnajb6O54946 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnajb6O54946 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dnajb6O54946 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Dnajb6O54946 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Dnajb6O54946 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dnajb6O54946 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Dnajb6O54946 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dnajb6O54946 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dnajb6O54946 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Dnajb6O54946 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Dnajb6O54946 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dnajb6O54946 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Dnajb6O54946 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Dnajb6O54946 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dnajb6O54946 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dnajb6O54946 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dnajb6O54946 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dnajb6O54946 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dnajb6O54946 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dnajb6O54946 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dnajb6O54946 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dnajb6O54946 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dnajb6O54946 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Dnajb6O54946 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dnajb6O54946 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Dnajb6O54946 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dnajb6O54946 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dnajb6O54946 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Dnajb6O54946 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Dnajb6O54946 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dnajb6O54946 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dnajb6O54946 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Dnajb6O54946 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dnajb6O54946 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dnajb6O54946 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dnajb6O54946 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dnajb6O54946 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dnajb6O54946 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dnajb6O54946 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dnajb6O54946 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dnajb6O54946 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dnajb6O54946 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms