Protein–RNA interactions for Protein: O54839

Eomes, Eomesodermin homolog, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EomesO54839 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EomesO54839 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EomesO54839 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EomesO54839 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EomesO54839 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EomesO54839 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EomesO54839 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EomesO54839 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EomesO54839 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EomesO54839 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EomesO54839 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EomesO54839 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EomesO54839 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EomesO54839 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EomesO54839 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EomesO54839 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EomesO54839 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EomesO54839 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EomesO54839 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EomesO54839 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EomesO54839 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EomesO54839 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EomesO54839 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EomesO54839 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EomesO54839 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EomesO54839 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EomesO54839 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EomesO54839 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EomesO54839 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EomesO54839 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EomesO54839 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EomesO54839 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EomesO54839 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EomesO54839 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EomesO54839 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EomesO54839 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EomesO54839 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EomesO54839 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EomesO54839 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EomesO54839 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EomesO54839 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EomesO54839 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EomesO54839 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EomesO54839 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EomesO54839 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EomesO54839 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EomesO54839 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EomesO54839 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EomesO54839 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EomesO54839 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EomesO54839 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EomesO54839 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EomesO54839 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EomesO54839 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EomesO54839 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EomesO54839 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EomesO54839 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EomesO54839 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EomesO54839 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EomesO54839 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EomesO54839 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EomesO54839 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EomesO54839 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EomesO54839 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EomesO54839 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EomesO54839 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EomesO54839 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EomesO54839 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EomesO54839 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EomesO54839 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EomesO54839 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EomesO54839 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EomesO54839 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EomesO54839 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EomesO54839 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EomesO54839 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EomesO54839 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EomesO54839 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EomesO54839 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EomesO54839 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EomesO54839 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EomesO54839 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EomesO54839 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EomesO54839 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EomesO54839 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EomesO54839 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EomesO54839 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EomesO54839 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EomesO54839 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EomesO54839 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EomesO54839 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EomesO54839 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EomesO54839 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EomesO54839 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EomesO54839 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EomesO54839 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EomesO54839 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EomesO54839 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EomesO54839 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EomesO54839 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms