Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrxO54751 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrxO54751 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrxO54751 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrxO54751 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrxO54751 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CrxO54751 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CrxO54751 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CrxO54751 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CrxO54751 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CrxO54751 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CrxO54751 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CrxO54751 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CrxO54751 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CrxO54751 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CrxO54751 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxO54751 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxO54751 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxO54751 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxO54751 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxO54751 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxO54751 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CrxO54751 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CrxO54751 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CrxO54751 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CrxO54751 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CrxO54751 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CrxO54751 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CrxO54751 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CrxO54751 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CrxO54751 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CrxO54751 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CrxO54751 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CrxO54751 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CrxO54751 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CrxO54751 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CrxO54751 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CrxO54751 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CrxO54751 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CrxO54751 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CrxO54751 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CrxO54751 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CrxO54751 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CrxO54751 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CrxO54751 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CrxO54751 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CrxO54751 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CrxO54751 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CrxO54751 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CrxO54751 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CrxO54751 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CrxO54751 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CrxO54751 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CrxO54751 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CrxO54751 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CrxO54751 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CrxO54751 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CrxO54751 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CrxO54751 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CrxO54751 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CrxO54751 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CrxO54751 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CrxO54751 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CrxO54751 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CrxO54751 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CrxO54751 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CrxO54751 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CrxO54751 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CrxO54751 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CrxO54751 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CrxO54751 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CrxO54751 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CrxO54751 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CrxO54751 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CrxO54751 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CrxO54751 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CrxO54751 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CrxO54751 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CrxO54751 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CrxO54751 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CrxO54751 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CrxO54751 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CrxO54751 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CrxO54751 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CrxO54751 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CrxO54751 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CrxO54751 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CrxO54751 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CrxO54751 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CrxO54751 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CrxO54751 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CrxO54751 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CrxO54751 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CrxO54751 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CrxO54751 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CrxO54751 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CrxO54751 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CrxO54751 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CrxO54751 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CrxO54751 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms