Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sp100O35892 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sp100O35892 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sp100O35892 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sp100O35892 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sp100O35892 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sp100O35892 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sp100O35892 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sp100O35892 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sp100O35892 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sp100O35892 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sp100O35892 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sp100O35892 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sp100O35892 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp100O35892 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sp100O35892 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp100O35892 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp100O35892 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp100O35892 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp100O35892 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp100O35892 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp100O35892 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sp100O35892 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp100O35892 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp100O35892 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sp100O35892 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sp100O35892 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp100O35892 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp100O35892 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp100O35892 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sp100O35892 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sp100O35892 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sp100O35892 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sp100O35892 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sp100O35892 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sp100O35892 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sp100O35892 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sp100O35892 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sp100O35892 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sp100O35892 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sp100O35892 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sp100O35892 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sp100O35892 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sp100O35892 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sp100O35892 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp100O35892 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp100O35892 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp100O35892 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sp100O35892 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp100O35892 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp100O35892 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp100O35892 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp100O35892 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sp100O35892 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sp100O35892 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp100O35892 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp100O35892 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sp100O35892 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp100O35892 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp100O35892 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sp100O35892 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp100O35892 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp100O35892 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp100O35892 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp100O35892 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp100O35892 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp100O35892 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sp100O35892 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp100O35892 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp100O35892 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp100O35892 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sp100O35892 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp100O35892 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp100O35892 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sp100O35892 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp100O35892 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp100O35892 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp100O35892 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp100O35892 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sp100O35892 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp100O35892 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp100O35892 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp100O35892 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sp100O35892 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp100O35892 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp100O35892 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp100O35892 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp100O35892 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sp100O35892 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp100O35892 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp100O35892 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp100O35892 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp100O35892 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp100O35892 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sp100O35892 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sp100O35892 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sp100O35892 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sp100O35892 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sp100O35892 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp100O35892 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
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