Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Abcc1O35379 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Abcc1O35379 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Abcc1O35379 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Abcc1O35379 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
Abcc1O35379 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Abcc1O35379 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Abcc1O35379 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
Abcc1O35379 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Abcc1O35379 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Abcc1O35379 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Abcc1O35379 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Abcc1O35379 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Abcc1O35379 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Abcc1O35379 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Abcc1O35379 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Abcc1O35379 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Abcc1O35379 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Abcc1O35379 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Abcc1O35379 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Abcc1O35379 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Abcc1O35379 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Abcc1O35379 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Abcc1O35379 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Abcc1O35379 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
Abcc1O35379 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Abcc1O35379 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Abcc1O35379 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Abcc1O35379 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Abcc1O35379 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Abcc1O35379 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Abcc1O35379 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Abcc1O35379 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Abcc1O35379 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
Abcc1O35379 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Abcc1O35379 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Abcc1O35379 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Abcc1O35379 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
Abcc1O35379 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Abcc1O35379 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Abcc1O35379 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Abcc1O35379 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
Abcc1O35379 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Abcc1O35379 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Abcc1O35379 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Abcc1O35379 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
Abcc1O35379 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Abcc1O35379 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
Abcc1O35379 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Abcc1O35379 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Abcc1O35379 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Abcc1O35379 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Abcc1O35379 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
Abcc1O35379 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
Abcc1O35379 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Abcc1O35379 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Abcc1O35379 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Abcc1O35379 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Abcc1O35379 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Abcc1O35379 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Abcc1O35379 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Abcc1O35379 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Abcc1O35379 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Abcc1O35379 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Abcc1O35379 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Abcc1O35379 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Abcc1O35379 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Abcc1O35379 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Abcc1O35379 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Abcc1O35379 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Abcc1O35379 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Abcc1O35379 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Abcc1O35379 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Abcc1O35379 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Abcc1O35379 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
Abcc1O35379 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Abcc1O35379 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
Abcc1O35379 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Abcc1O35379 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Abcc1O35379 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Abcc1O35379 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Abcc1O35379 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Abcc1O35379 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Abcc1O35379 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Abcc1O35379 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Abcc1O35379 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Abcc1O35379 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Abcc1O35379 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Abcc1O35379 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
Abcc1O35379 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Abcc1O35379 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Abcc1O35379 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
Abcc1O35379 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
Abcc1O35379 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Abcc1O35379 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Abcc1O35379 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
Abcc1O35379 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Abcc1O35379 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Abcc1O35379 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Abcc1O35379 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms