Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClockO08785 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClockO08785 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClockO08785 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClockO08785 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClockO08785 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClockO08785 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClockO08785 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ClockO08785 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClockO08785 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClockO08785 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClockO08785 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClockO08785 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClockO08785 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClockO08785 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClockO08785 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClockO08785 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClockO08785 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClockO08785 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClockO08785 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClockO08785 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClockO08785 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClockO08785 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClockO08785 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClockO08785 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClockO08785 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClockO08785 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ClockO08785 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ClockO08785 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ClockO08785 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ClockO08785 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClockO08785 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClockO08785 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClockO08785 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ClockO08785 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClockO08785 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ClockO08785 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ClockO08785 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ClockO08785 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ClockO08785 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ClockO08785 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClockO08785 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClockO08785 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClockO08785 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClockO08785 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClockO08785 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClockO08785 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClockO08785 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClockO08785 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClockO08785 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ClockO08785 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ClockO08785 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ClockO08785 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ClockO08785 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ClockO08785 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ClockO08785 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClockO08785 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClockO08785 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClockO08785 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClockO08785 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClockO08785 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClockO08785 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClockO08785 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClockO08785 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClockO08785 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClockO08785 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClockO08785 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClockO08785 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClockO08785 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClockO08785 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClockO08785 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClockO08785 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClockO08785 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClockO08785 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClockO08785 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClockO08785 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClockO08785 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ClockO08785 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ClockO08785 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ClockO08785 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ClockO08785 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ClockO08785 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ClockO08785 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ClockO08785 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ClockO08785 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClockO08785 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClockO08785 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClockO08785 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClockO08785 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClockO08785 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClockO08785 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClockO08785 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClockO08785 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClockO08785 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClockO08785 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClockO08785 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClockO08785 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClockO08785 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClockO08785 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClockO08785 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms