Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Vwa3bJ9JI28 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vwa3bJ9JI28 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Vwa3bJ9JI28 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Vwa3bJ9JI28 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Vwa3bJ9JI28 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Vwa3bJ9JI28 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Vwa3bJ9JI28 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vwa3bJ9JI28 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Vwa3bJ9JI28 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Vwa3bJ9JI28 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Vwa3bJ9JI28 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Vwa3bJ9JI28 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vwa3bJ9JI28 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Vwa3bJ9JI28 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vwa3bJ9JI28 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vwa3bJ9JI28 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vwa3bJ9JI28 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Vwa3bJ9JI28 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Vwa3bJ9JI28 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Vwa3bJ9JI28 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vwa3bJ9JI28 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Vwa3bJ9JI28 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Vwa3bJ9JI28 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Vwa3bJ9JI28 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Vwa3bJ9JI28 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Vwa3bJ9JI28 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Vwa3bJ9JI28 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Vwa3bJ9JI28 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Vwa3bJ9JI28 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Vwa3bJ9JI28 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Vwa3bJ9JI28 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Vwa3bJ9JI28 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Vwa3bJ9JI28 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Vwa3bJ9JI28 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Vwa3bJ9JI28 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Vwa3bJ9JI28 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Vwa3bJ9JI28 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Vwa3bJ9JI28 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Vwa3bJ9JI28 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Vwa3bJ9JI28 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Vwa3bJ9JI28 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Vwa3bJ9JI28 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Vwa3bJ9JI28 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Vwa3bJ9JI28 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vwa3bJ9JI28 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vwa3bJ9JI28 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vwa3bJ9JI28 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Vwa3bJ9JI28 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vwa3bJ9JI28 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Vwa3bJ9JI28 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vwa3bJ9JI28 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vwa3bJ9JI28 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Vwa3bJ9JI28 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Vwa3bJ9JI28 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Vwa3bJ9JI28 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Vwa3bJ9JI28 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vwa3bJ9JI28 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Vwa3bJ9JI28 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Vwa3bJ9JI28 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vwa3bJ9JI28 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Vwa3bJ9JI28 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vwa3bJ9JI28 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Vwa3bJ9JI28 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vwa3bJ9JI28 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vwa3bJ9JI28 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vwa3bJ9JI28 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Vwa3bJ9JI28 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Vwa3bJ9JI28 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Vwa3bJ9JI28 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Vwa3bJ9JI28 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Vwa3bJ9JI28 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Vwa3bJ9JI28 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Vwa3bJ9JI28 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Vwa3bJ9JI28 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Vwa3bJ9JI28 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Vwa3bJ9JI28 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vwa3bJ9JI28 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vwa3bJ9JI28 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vwa3bJ9JI28 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Vwa3bJ9JI28 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vwa3bJ9JI28 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Vwa3bJ9JI28 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vwa3bJ9JI28 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vwa3bJ9JI28 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Vwa3bJ9JI28 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Vwa3bJ9JI28 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Vwa3bJ9JI28 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Vwa3bJ9JI28 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Vwa3bJ9JI28 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Vwa3bJ9JI28 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Vwa3bJ9JI28 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Vwa3bJ9JI28 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Vwa3bJ9JI28 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Vwa3bJ9JI28 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vwa3bJ9JI28 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vwa3bJ9JI28 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Vwa3bJ9JI28 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vwa3bJ9JI28 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Vwa3bJ9JI28 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms