Protein–RNA interactions for Protein: J3QPW6

1700122O11Rik, MCG53587, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700122O11RikJ3QPW6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700122O11RikJ3QPW6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700122O11RikJ3QPW6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700122O11RikJ3QPW6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700122O11RikJ3QPW6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700122O11RikJ3QPW6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700122O11RikJ3QPW6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700122O11RikJ3QPW6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700122O11RikJ3QPW6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
1700122O11RikJ3QPW6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
1700122O11RikJ3QPW6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700122O11RikJ3QPW6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700122O11RikJ3QPW6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700122O11RikJ3QPW6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700122O11RikJ3QPW6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700122O11RikJ3QPW6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
1700122O11RikJ3QPW6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700122O11RikJ3QPW6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700122O11RikJ3QPW6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700122O11RikJ3QPW6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700122O11RikJ3QPW6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700122O11RikJ3QPW6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700122O11RikJ3QPW6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700122O11RikJ3QPW6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700122O11RikJ3QPW6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700122O11RikJ3QPW6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700122O11RikJ3QPW6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700122O11RikJ3QPW6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700122O11RikJ3QPW6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700122O11RikJ3QPW6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700122O11RikJ3QPW6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700122O11RikJ3QPW6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700122O11RikJ3QPW6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
1700122O11RikJ3QPW6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700122O11RikJ3QPW6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700122O11RikJ3QPW6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700122O11RikJ3QPW6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
1700122O11RikJ3QPW6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
1700122O11RikJ3QPW6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700122O11RikJ3QPW6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700122O11RikJ3QPW6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700122O11RikJ3QPW6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700122O11RikJ3QPW6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700122O11RikJ3QPW6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700122O11RikJ3QPW6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700122O11RikJ3QPW6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700122O11RikJ3QPW6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700122O11RikJ3QPW6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700122O11RikJ3QPW6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
1700122O11RikJ3QPW6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700122O11RikJ3QPW6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
1700122O11RikJ3QPW6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
1700122O11RikJ3QPW6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700122O11RikJ3QPW6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700122O11RikJ3QPW6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700122O11RikJ3QPW6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
1700122O11RikJ3QPW6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700122O11RikJ3QPW6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
1700122O11RikJ3QPW6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700122O11RikJ3QPW6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700122O11RikJ3QPW6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700122O11RikJ3QPW6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700122O11RikJ3QPW6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700122O11RikJ3QPW6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700122O11RikJ3QPW6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700122O11RikJ3QPW6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700122O11RikJ3QPW6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700122O11RikJ3QPW6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700122O11RikJ3QPW6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
1700122O11RikJ3QPW6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
1700122O11RikJ3QPW6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
1700122O11RikJ3QPW6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
1700122O11RikJ3QPW6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1700122O11RikJ3QPW6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
1700122O11RikJ3QPW6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
1700122O11RikJ3QPW6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
1700122O11RikJ3QPW6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700122O11RikJ3QPW6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700122O11RikJ3QPW6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
1700122O11RikJ3QPW6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700122O11RikJ3QPW6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
1700122O11RikJ3QPW6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
1700122O11RikJ3QPW6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700122O11RikJ3QPW6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700122O11RikJ3QPW6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700122O11RikJ3QPW6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700122O11RikJ3QPW6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700122O11RikJ3QPW6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700122O11RikJ3QPW6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700122O11RikJ3QPW6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700122O11RikJ3QPW6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700122O11RikJ3QPW6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700122O11RikJ3QPW6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700122O11RikJ3QPW6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700122O11RikJ3QPW6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700122O11RikJ3QPW6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700122O11RikJ3QPW6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700122O11RikJ3QPW6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700122O11RikJ3QPW6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700122O11RikJ3QPW6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms