Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21972J3QN38 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm21972J3QN38 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21972J3QN38 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21972J3QN38 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21972J3QN38 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21972J3QN38 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm21972J3QN38 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm21972J3QN38 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm21972J3QN38 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21972J3QN38 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21972J3QN38 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21972J3QN38 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm21972J3QN38 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm21972J3QN38 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm21972J3QN38 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm21972J3QN38 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm21972J3QN38 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21972J3QN38 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21972J3QN38 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21972J3QN38 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm21972J3QN38 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm21972J3QN38 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21972J3QN38 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21972J3QN38 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21972J3QN38 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21972J3QN38 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21972J3QN38 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21972J3QN38 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm21972J3QN38 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21972J3QN38 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21972J3QN38 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21972J3QN38 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21972J3QN38 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21972J3QN38 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21972J3QN38 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm21972J3QN38 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21972J3QN38 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm21972J3QN38 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm21972J3QN38 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21972J3QN38 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21972J3QN38 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm21972J3QN38 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21972J3QN38 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm21972J3QN38 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm21972J3QN38 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm21972J3QN38 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm21972J3QN38 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21972J3QN38 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21972J3QN38 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21972J3QN38 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21972J3QN38 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm21972J3QN38 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21972J3QN38 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21972J3QN38 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm21972J3QN38 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21972J3QN38 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21972J3QN38 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm21972J3QN38 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21972J3QN38 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21972J3QN38 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21972J3QN38 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm21972J3QN38 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21972J3QN38 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21972J3QN38 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm21972J3QN38 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21972J3QN38 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21972J3QN38 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21972J3QN38 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21972J3QN38 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21972J3QN38 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21972J3QN38 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms