Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc179J3QM76 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc179J3QM76 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc179J3QM76 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc179J3QM76 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc179J3QM76 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc179J3QM76 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc179J3QM76 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc179J3QM76 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc179J3QM76 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc179J3QM76 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc179J3QM76 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc179J3QM76 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc179J3QM76 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc179J3QM76 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc179J3QM76 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc179J3QM76 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc179J3QM76 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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