Protein–RNA interactions for Protein: F7BTS7

Gm5798, Predicted gene 5798, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5798F7BTS7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm5798F7BTS7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5798F7BTS7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5798F7BTS7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5798F7BTS7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5798F7BTS7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5798F7BTS7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5798F7BTS7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5798F7BTS7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5798F7BTS7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5798F7BTS7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5798F7BTS7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5798F7BTS7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5798F7BTS7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5798F7BTS7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5798F7BTS7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5798F7BTS7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5798F7BTS7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5798F7BTS7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5798F7BTS7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5798F7BTS7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5798F7BTS7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5798F7BTS7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5798F7BTS7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5798F7BTS7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5798F7BTS7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5798F7BTS7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5798F7BTS7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5798F7BTS7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5798F7BTS7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5798F7BTS7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5798F7BTS7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5798F7BTS7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5798F7BTS7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5798F7BTS7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5798F7BTS7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5798F7BTS7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5798F7BTS7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5798F7BTS7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5798F7BTS7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5798F7BTS7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5798F7BTS7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm5798F7BTS7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm5798F7BTS7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5798F7BTS7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm5798F7BTS7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm5798F7BTS7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm5798F7BTS7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm5798F7BTS7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5798F7BTS7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5798F7BTS7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5798F7BTS7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5798F7BTS7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5798F7BTS7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5798F7BTS7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5798F7BTS7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5798F7BTS7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5798F7BTS7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5798F7BTS7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5798F7BTS7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5798F7BTS7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5798F7BTS7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm5798F7BTS7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm5798F7BTS7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm5798F7BTS7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm5798F7BTS7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm5798F7BTS7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5798F7BTS7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5798F7BTS7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5798F7BTS7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5798F7BTS7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5798F7BTS7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5798F7BTS7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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