Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm8220F6YKI2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm8220F6YKI2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8220F6YKI2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8220F6YKI2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm8220F6YKI2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8220F6YKI2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8220F6YKI2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8220F6YKI2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8220F6YKI2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8220F6YKI2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8220F6YKI2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm8220F6YKI2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm8220F6YKI2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm8220F6YKI2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8220F6YKI2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8220F6YKI2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm8220F6YKI2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm8220F6YKI2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm8220F6YKI2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm8220F6YKI2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8220F6YKI2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8220F6YKI2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8220F6YKI2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8220F6YKI2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8220F6YKI2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm8220F6YKI2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8220F6YKI2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm8220F6YKI2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8220F6YKI2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8220F6YKI2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8220F6YKI2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8220F6YKI2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm8220F6YKI2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8220F6YKI2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8220F6YKI2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8220F6YKI2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm8220F6YKI2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8220F6YKI2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8220F6YKI2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm8220F6YKI2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8220F6YKI2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8220F6YKI2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm8220F6YKI2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8220F6YKI2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8220F6YKI2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm8220F6YKI2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm8220F6YKI2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm8220F6YKI2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm8220F6YKI2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms