Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igkv1-99F6XWB2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igkv1-99F6XWB2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igkv1-99F6XWB2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Igkv1-99F6XWB2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igkv1-99F6XWB2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igkv1-99F6XWB2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Igkv1-99F6XWB2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igkv1-99F6XWB2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igkv1-99F6XWB2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igkv1-99F6XWB2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Igkv1-99F6XWB2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igkv1-99F6XWB2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igkv1-99F6XWB2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igkv1-99F6XWB2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igkv1-99F6XWB2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Igkv1-99F6XWB2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Igkv1-99F6XWB2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Igkv1-99F6XWB2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igkv1-99F6XWB2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igkv1-99F6XWB2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igkv1-99F6XWB2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igkv1-99F6XWB2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igkv1-99F6XWB2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Igkv1-99F6XWB2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Igkv1-99F6XWB2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igkv1-99F6XWB2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igkv1-99F6XWB2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igkv1-99F6XWB2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Igkv1-99F6XWB2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igkv1-99F6XWB2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Igkv1-99F6XWB2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igkv1-99F6XWB2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Igkv1-99F6XWB2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Igkv1-99F6XWB2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Igkv1-99F6XWB2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Igkv1-99F6XWB2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Igkv1-99F6XWB2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Igkv1-99F6XWB2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Igkv1-99F6XWB2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Igkv1-99F6XWB2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Igkv1-99F6XWB2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Igkv1-99F6XWB2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms