Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc7bE9Q9Y3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc7bE9Q9Y3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc7bE9Q9Y3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc7bE9Q9Y3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc7bE9Q9Y3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc7bE9Q9Y3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc7bE9Q9Y3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc7bE9Q9Y3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc7bE9Q9Y3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc7bE9Q9Y3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc7bE9Q9Y3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc7bE9Q9Y3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc7bE9Q9Y3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc7bE9Q9Y3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc7bE9Q9Y3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc7bE9Q9Y3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc7bE9Q9Y3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms