Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Urb2E9Q7L1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Urb2E9Q7L1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Urb2E9Q7L1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.06
Urb2E9Q7L1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Urb2E9Q7L1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Urb2E9Q7L1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Urb2E9Q7L1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Urb2E9Q7L1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Urb2E9Q7L1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
Urb2E9Q7L1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Urb2E9Q7L1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
Urb2E9Q7L1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Urb2E9Q7L1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
Urb2E9Q7L1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Urb2E9Q7L1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Urb2E9Q7L1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
Urb2E9Q7L1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
Urb2E9Q7L1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Urb2E9Q7L1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Urb2E9Q7L1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Urb2E9Q7L1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
Urb2E9Q7L1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Urb2E9Q7L1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Urb2E9Q7L1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Urb2E9Q7L1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Urb2E9Q7L1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Urb2E9Q7L1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Urb2E9Q7L1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Urb2E9Q7L1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Urb2E9Q7L1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Urb2E9Q7L1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Urb2E9Q7L1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
Urb2E9Q7L1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Urb2E9Q7L1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
Urb2E9Q7L1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
Urb2E9Q7L1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Urb2E9Q7L1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
Urb2E9Q7L1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Urb2E9Q7L1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Urb2E9Q7L1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Urb2E9Q7L1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Urb2E9Q7L1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
Urb2E9Q7L1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Urb2E9Q7L1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Urb2E9Q7L1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Urb2E9Q7L1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
Urb2E9Q7L1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
Urb2E9Q7L1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
Urb2E9Q7L1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC40.07■■■■■ 4.01
Urb2E9Q7L1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
Urb2E9Q7L1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Urb2E9Q7L1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Urb2E9Q7L1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC40.06■■■■■ 4
Urb2E9Q7L1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
Urb2E9Q7L1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Urb2E9Q7L1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Urb2E9Q7L1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Urb2E9Q7L1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Urb2E9Q7L1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
Urb2E9Q7L1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Urb2E9Q7L1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Urb2E9Q7L1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
Urb2E9Q7L1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Urb2E9Q7L1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC40.01■■■■□ 3.99
Urb2E9Q7L1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Urb2E9Q7L1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Urb2E9Q7L1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Urb2E9Q7L1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Urb2E9Q7L1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Urb2E9Q7L1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Urb2E9Q7L1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Urb2E9Q7L1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Urb2E9Q7L1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Urb2E9Q7L1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Urb2E9Q7L1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Urb2E9Q7L1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
Urb2E9Q7L1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
Urb2E9Q7L1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Urb2E9Q7L1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
Urb2E9Q7L1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Urb2E9Q7L1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Urb2E9Q7L1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Urb2E9Q7L1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
Urb2E9Q7L1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Urb2E9Q7L1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Urb2E9Q7L1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Urb2E9Q7L1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Urb2E9Q7L1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Urb2E9Q7L1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
Urb2E9Q7L1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
Urb2E9Q7L1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Urb2E9Q7L1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Urb2E9Q7L1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
Urb2E9Q7L1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Urb2E9Q7L1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Urb2E9Q7L1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Urb2E9Q7L1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Urb2E9Q7L1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
Urb2E9Q7L1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms