Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0A8

Krtap20-2, Keratin-associated protein 20-2, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap20-2E9Q0A8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Krtap20-2E9Q0A8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Krtap20-2E9Q0A8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms