Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ryr1E9PZQ0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ryr1E9PZQ0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ryr1E9PZQ0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ryr1E9PZQ0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ryr1E9PZQ0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ryr1E9PZQ0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ryr1E9PZQ0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ryr1E9PZQ0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ryr1E9PZQ0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ryr1E9PZQ0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ryr1E9PZQ0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ryr1E9PZQ0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ryr1E9PZQ0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ryr1E9PZQ0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ryr1E9PZQ0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ryr1E9PZQ0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ryr1E9PZQ0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ryr1E9PZQ0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ryr1E9PZQ0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ryr1E9PZQ0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ryr1E9PZQ0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ryr1E9PZQ0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ryr1E9PZQ0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ryr1E9PZQ0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ryr1E9PZQ0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ryr1E9PZQ0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ryr1E9PZQ0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ryr1E9PZQ0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ryr1E9PZQ0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ryr1E9PZQ0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ryr1E9PZQ0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ryr1E9PZQ0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ryr1E9PZQ0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ryr1E9PZQ0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ryr1E9PZQ0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ryr1E9PZQ0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ryr1E9PZQ0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ryr1E9PZQ0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ryr1E9PZQ0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ryr1E9PZQ0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ryr1E9PZQ0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ryr1E9PZQ0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ryr1E9PZQ0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ryr1E9PZQ0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ryr1E9PZQ0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ryr1E9PZQ0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ryr1E9PZQ0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ryr1E9PZQ0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ryr1E9PZQ0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ryr1E9PZQ0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ryr1E9PZQ0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ryr1E9PZQ0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ryr1E9PZQ0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ryr1E9PZQ0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ryr1E9PZQ0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ryr1E9PZQ0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ryr1E9PZQ0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ryr1E9PZQ0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ryr1E9PZQ0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ryr1E9PZQ0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ryr1E9PZQ0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ryr1E9PZQ0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ryr1E9PZQ0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ryr1E9PZQ0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ryr1E9PZQ0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ryr1E9PZQ0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ryr1E9PZQ0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms