Protein–RNA interactions for Protein: E9PXJ8

Vmn2r90, Vomeronasal 2, receptor 90, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r90E9PXJ8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn2r90E9PXJ8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r90E9PXJ8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vmn2r90E9PXJ8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn2r90E9PXJ8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r90E9PXJ8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r90E9PXJ8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r90E9PXJ8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r90E9PXJ8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn2r90E9PXJ8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r90E9PXJ8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn2r90E9PXJ8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r90E9PXJ8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r90E9PXJ8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r90E9PXJ8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r90E9PXJ8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r90E9PXJ8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn2r90E9PXJ8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r90E9PXJ8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r90E9PXJ8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r90E9PXJ8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn2r90E9PXJ8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r90E9PXJ8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn2r90E9PXJ8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r90E9PXJ8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r90E9PXJ8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r90E9PXJ8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r90E9PXJ8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn2r90E9PXJ8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r90E9PXJ8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r90E9PXJ8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r90E9PXJ8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn2r90E9PXJ8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r90E9PXJ8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r90E9PXJ8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn2r90E9PXJ8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r90E9PXJ8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r90E9PXJ8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r90E9PXJ8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn2r90E9PXJ8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r90E9PXJ8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r90E9PXJ8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r90E9PXJ8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r90E9PXJ8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r90E9PXJ8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r90E9PXJ8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn2r90E9PXJ8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r90E9PXJ8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r90E9PXJ8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn2r90E9PXJ8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn2r90E9PXJ8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn2r90E9PXJ8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn2r90E9PXJ8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r90E9PXJ8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r90E9PXJ8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn2r90E9PXJ8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r90E9PXJ8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn2r90E9PXJ8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r90E9PXJ8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r90E9PXJ8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r90E9PXJ8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn2r90E9PXJ8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r90E9PXJ8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r90E9PXJ8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn2r90E9PXJ8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r90E9PXJ8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r90E9PXJ8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r90E9PXJ8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn2r90E9PXJ8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn2r90E9PXJ8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r90E9PXJ8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r90E9PXJ8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn2r90E9PXJ8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms