Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifit3bE9PV48 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifit3bE9PV48 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifit3bE9PV48 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifit3bE9PV48 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifit3bE9PV48 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifit3bE9PV48 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifit3bE9PV48 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifit3bE9PV48 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifit3bE9PV48 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifit3bE9PV48 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifit3bE9PV48 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifit3bE9PV48 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ifit3bE9PV48 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifit3bE9PV48 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifit3bE9PV48 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifit3bE9PV48 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifit3bE9PV48 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifit3bE9PV48 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ifit3bE9PV48 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifit3bE9PV48 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifit3bE9PV48 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifit3bE9PV48 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifit3bE9PV48 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifit3bE9PV48 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifit3bE9PV48 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifit3bE9PV48 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifit3bE9PV48 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifit3bE9PV48 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifit3bE9PV48 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifit3bE9PV48 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifit3bE9PV48 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifit3bE9PV48 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifit3bE9PV48 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifit3bE9PV48 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifit3bE9PV48 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifit3bE9PV48 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifit3bE9PV48 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifit3bE9PV48 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifit3bE9PV48 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifit3bE9PV48 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifit3bE9PV48 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifit3bE9PV48 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifit3bE9PV48 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifit3bE9PV48 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifit3bE9PV48 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifit3bE9PV48 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifit3bE9PV48 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifit3bE9PV48 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifit3bE9PV48 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifit3bE9PV48 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifit3bE9PV48 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifit3bE9PV48 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifit3bE9PV48 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifit3bE9PV48 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifit3bE9PV48 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifit3bE9PV48 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifit3bE9PV48 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifit3bE9PV48 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifit3bE9PV48 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifit3bE9PV48 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifit3bE9PV48 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifit3bE9PV48 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifit3bE9PV48 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifit3bE9PV48 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifit3bE9PV48 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifit3bE9PV48 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifit3bE9PV48 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifit3bE9PV48 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifit3bE9PV48 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifit3bE9PV48 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifit3bE9PV48 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifit3bE9PV48 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifit3bE9PV48 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifit3bE9PV48 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifit3bE9PV48 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifit3bE9PV48 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifit3bE9PV48 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifit3bE9PV48 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifit3bE9PV48 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ifit3bE9PV48 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ifit3bE9PV48 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifit3bE9PV48 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms