Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Piezo1E2JF22 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Piezo1E2JF22 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Piezo1E2JF22 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Piezo1E2JF22 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Piezo1E2JF22 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Piezo1E2JF22 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Piezo1E2JF22 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Piezo1E2JF22 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Piezo1E2JF22 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Piezo1E2JF22 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Piezo1E2JF22 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Piezo1E2JF22 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Piezo1E2JF22 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Piezo1E2JF22 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Piezo1E2JF22 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Piezo1E2JF22 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Piezo1E2JF22 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Piezo1E2JF22 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Piezo1E2JF22 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Piezo1E2JF22 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Piezo1E2JF22 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Piezo1E2JF22 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Piezo1E2JF22 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Piezo1E2JF22 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Piezo1E2JF22 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Piezo1E2JF22 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Piezo1E2JF22 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Piezo1E2JF22 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Piezo1E2JF22 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Piezo1E2JF22 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Piezo1E2JF22 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Piezo1E2JF22 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Piezo1E2JF22 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Piezo1E2JF22 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Piezo1E2JF22 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Piezo1E2JF22 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Piezo1E2JF22 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Piezo1E2JF22 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Piezo1E2JF22 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Piezo1E2JF22 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Piezo1E2JF22 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Piezo1E2JF22 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Piezo1E2JF22 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Piezo1E2JF22 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Piezo1E2JF22 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Piezo1E2JF22 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Piezo1E2JF22 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Piezo1E2JF22 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Piezo1E2JF22 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Piezo1E2JF22 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Piezo1E2JF22 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Piezo1E2JF22 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Piezo1E2JF22 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Piezo1E2JF22 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Piezo1E2JF22 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Piezo1E2JF22 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Piezo1E2JF22 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Piezo1E2JF22 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Piezo1E2JF22 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Piezo1E2JF22 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Piezo1E2JF22 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Piezo1E2JF22 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Piezo1E2JF22 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Piezo1E2JF22 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Piezo1E2JF22 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Piezo1E2JF22 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Piezo1E2JF22 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Piezo1E2JF22 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Piezo1E2JF22 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Piezo1E2JF22 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Piezo1E2JF22 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Piezo1E2JF22 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Piezo1E2JF22 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Piezo1E2JF22 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Piezo1E2JF22 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Piezo1E2JF22 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Piezo1E2JF22 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Piezo1E2JF22 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Piezo1E2JF22 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Piezo1E2JF22 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Piezo1E2JF22 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Piezo1E2JF22 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Piezo1E2JF22 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Piezo1E2JF22 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Piezo1E2JF22 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Piezo1E2JF22 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Piezo1E2JF22 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Piezo1E2JF22 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Piezo1E2JF22 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Piezo1E2JF22 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Piezo1E2JF22 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Piezo1E2JF22 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Piezo1E2JF22 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Piezo1E2JF22 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Piezo1E2JF22 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Piezo1E2JF22 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Piezo1E2JF22 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Piezo1E2JF22 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Piezo1E2JF22 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms