Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
3425401B19RikD3Z1D3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
3425401B19RikD3Z1D3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
3425401B19RikD3Z1D3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
3425401B19RikD3Z1D3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
3425401B19RikD3Z1D3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
3425401B19RikD3Z1D3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
3425401B19RikD3Z1D3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
3425401B19RikD3Z1D3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
3425401B19RikD3Z1D3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
3425401B19RikD3Z1D3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
3425401B19RikD3Z1D3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
3425401B19RikD3Z1D3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
3425401B19RikD3Z1D3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
3425401B19RikD3Z1D3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
3425401B19RikD3Z1D3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
3425401B19RikD3Z1D3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
3425401B19RikD3Z1D3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
3425401B19RikD3Z1D3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.34■■■■□ 3.41
3425401B19RikD3Z1D3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
3425401B19RikD3Z1D3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
3425401B19RikD3Z1D3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
3425401B19RikD3Z1D3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
3425401B19RikD3Z1D3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
3425401B19RikD3Z1D3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
3425401B19RikD3Z1D3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
3425401B19RikD3Z1D3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
3425401B19RikD3Z1D3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
3425401B19RikD3Z1D3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
3425401B19RikD3Z1D3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
3425401B19RikD3Z1D3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
3425401B19RikD3Z1D3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
3425401B19RikD3Z1D3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
3425401B19RikD3Z1D3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
3425401B19RikD3Z1D3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
3425401B19RikD3Z1D3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
3425401B19RikD3Z1D3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
3425401B19RikD3Z1D3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
3425401B19RikD3Z1D3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
3425401B19RikD3Z1D3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
3425401B19RikD3Z1D3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
3425401B19RikD3Z1D3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
3425401B19RikD3Z1D3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
3425401B19RikD3Z1D3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
3425401B19RikD3Z1D3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
3425401B19RikD3Z1D3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
3425401B19RikD3Z1D3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
3425401B19RikD3Z1D3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
3425401B19RikD3Z1D3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
3425401B19RikD3Z1D3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
3425401B19RikD3Z1D3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
3425401B19RikD3Z1D3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
3425401B19RikD3Z1D3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
3425401B19RikD3Z1D3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
3425401B19RikD3Z1D3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
3425401B19RikD3Z1D3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
3425401B19RikD3Z1D3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
3425401B19RikD3Z1D3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
3425401B19RikD3Z1D3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
3425401B19RikD3Z1D3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
3425401B19RikD3Z1D3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
3425401B19RikD3Z1D3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
3425401B19RikD3Z1D3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
3425401B19RikD3Z1D3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
3425401B19RikD3Z1D3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
3425401B19RikD3Z1D3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
3425401B19RikD3Z1D3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
3425401B19RikD3Z1D3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
3425401B19RikD3Z1D3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
3425401B19RikD3Z1D3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
3425401B19RikD3Z1D3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
3425401B19RikD3Z1D3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
3425401B19RikD3Z1D3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
3425401B19RikD3Z1D3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
3425401B19RikD3Z1D3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
3425401B19RikD3Z1D3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
3425401B19RikD3Z1D3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
3425401B19RikD3Z1D3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
3425401B19RikD3Z1D3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
3425401B19RikD3Z1D3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
3425401B19RikD3Z1D3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
3425401B19RikD3Z1D3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
3425401B19RikD3Z1D3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
3425401B19RikD3Z1D3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
3425401B19RikD3Z1D3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
3425401B19RikD3Z1D3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
3425401B19RikD3Z1D3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
3425401B19RikD3Z1D3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
3425401B19RikD3Z1D3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
3425401B19RikD3Z1D3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms