Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nxpe3B9EKK6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nxpe3B9EKK6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nxpe3B9EKK6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nxpe3B9EKK6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nxpe3B9EKK6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nxpe3B9EKK6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nxpe3B9EKK6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nxpe3B9EKK6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nxpe3B9EKK6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nxpe3B9EKK6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nxpe3B9EKK6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nxpe3B9EKK6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nxpe3B9EKK6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nxpe3B9EKK6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nxpe3B9EKK6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nxpe3B9EKK6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nxpe3B9EKK6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nxpe3B9EKK6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nxpe3B9EKK6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nxpe3B9EKK6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nxpe3B9EKK6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nxpe3B9EKK6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nxpe3B9EKK6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nxpe3B9EKK6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nxpe3B9EKK6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nxpe3B9EKK6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nxpe3B9EKK6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nxpe3B9EKK6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nxpe3B9EKK6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nxpe3B9EKK6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nxpe3B9EKK6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nxpe3B9EKK6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nxpe3B9EKK6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nxpe3B9EKK6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nxpe3B9EKK6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nxpe3B9EKK6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Nxpe3B9EKK6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nxpe3B9EKK6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nxpe3B9EKK6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nxpe3B9EKK6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nxpe3B9EKK6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nxpe3B9EKK6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nxpe3B9EKK6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nxpe3B9EKK6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nxpe3B9EKK6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nxpe3B9EKK6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nxpe3B9EKK6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nxpe3B9EKK6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nxpe3B9EKK6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nxpe3B9EKK6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nxpe3B9EKK6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nxpe3B9EKK6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nxpe3B9EKK6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nxpe3B9EKK6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nxpe3B9EKK6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nxpe3B9EKK6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nxpe3B9EKK6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nxpe3B9EKK6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nxpe3B9EKK6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nxpe3B9EKK6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nxpe3B9EKK6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nxpe3B9EKK6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nxpe3B9EKK6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nxpe3B9EKK6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nxpe3B9EKK6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nxpe3B9EKK6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nxpe3B9EKK6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nxpe3B9EKK6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nxpe3B9EKK6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nxpe3B9EKK6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nxpe3B9EKK6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nxpe3B9EKK6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nxpe3B9EKK6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nxpe3B9EKK6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nxpe3B9EKK6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nxpe3B9EKK6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nxpe3B9EKK6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nxpe3B9EKK6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nxpe3B9EKK6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nxpe3B9EKK6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nxpe3B9EKK6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nxpe3B9EKK6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nxpe3B9EKK6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nxpe3B9EKK6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nxpe3B9EKK6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nxpe3B9EKK6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nxpe3B9EKK6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nxpe3B9EKK6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nxpe3B9EKK6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nxpe3B9EKK6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nxpe3B9EKK6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nxpe3B9EKK6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nxpe3B9EKK6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nxpe3B9EKK6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nxpe3B9EKK6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nxpe3B9EKK6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nxpe3B9EKK6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nxpe3B9EKK6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nxpe3B9EKK6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms