Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC50.52■■■■■ 5.68
Abcc8B2RUS7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.51■■■■■ 5.68
Abcc8B2RUS7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.51■■■■■ 5.68
Abcc8B2RUS7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC50.51■■■■■ 5.68
Abcc8B2RUS7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC50.48■■■■■ 5.67
Abcc8B2RUS7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC50.48■■■■■ 5.67
Abcc8B2RUS7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.47■■■■■ 5.67
Abcc8B2RUS7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.47■■■■■ 5.67
Abcc8B2RUS7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC50.47■■■■■ 5.67
Abcc8B2RUS7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.46■■■■■ 5.67
Abcc8B2RUS7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
Abcc8B2RUS7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.44■■■■■ 5.66
Abcc8B2RUS7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC50.43■■■■■ 5.66
Abcc8B2RUS7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC50.43■■■■■ 5.66
Abcc8B2RUS7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.43■■■■■ 5.66
Abcc8B2RUS7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC50.42■■■■■ 5.66
Abcc8B2RUS7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.41■■■■■ 5.66
Abcc8B2RUS7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.41■■■■■ 5.66
Abcc8B2RUS7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC50.41■■■■■ 5.66
Abcc8B2RUS7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC50.39■■■■■ 5.66
Abcc8B2RUS7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.36■■■■■ 5.65
Abcc8B2RUS7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC50.35■■■■■ 5.65
Abcc8B2RUS7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC50.35■■■■■ 5.65
Abcc8B2RUS7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.33■■■■■ 5.65
Abcc8B2RUS7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC50.33■■■■■ 5.65
Abcc8B2RUS7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC50.33■■■■■ 5.65
Abcc8B2RUS7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC50.33■■■■■ 5.65
Abcc8B2RUS7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC50.33■■■■■ 5.65
Abcc8B2RUS7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC50.33■■■■■ 5.65
Abcc8B2RUS7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC50.31■■■■■ 5.64
Abcc8B2RUS7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.31■■■■■ 5.64
Abcc8B2RUS7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.31■■■■■ 5.64
Abcc8B2RUS7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.3■■■■■ 5.64
Abcc8B2RUS7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
Abcc8B2RUS7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
Abcc8B2RUS7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC50.26■■■■■ 5.64
Abcc8B2RUS7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.25■■■■■ 5.63
Abcc8B2RUS7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC50.25■■■■■ 5.63
Abcc8B2RUS7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC50.24■■■■■ 5.63
Abcc8B2RUS7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC50.23■■■■■ 5.63
Abcc8B2RUS7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC50.21■■■■■ 5.63
Abcc8B2RUS7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC50.19■■■■■ 5.63
Abcc8B2RUS7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC50.18■■■■■ 5.62
Abcc8B2RUS7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.17■■■■■ 5.62
Abcc8B2RUS7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.17■■■■■ 5.62
Abcc8B2RUS7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC50.16■■■■■ 5.62
Abcc8B2RUS7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC50.16■■■■■ 5.62
Abcc8B2RUS7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.15■■■■■ 5.62
Abcc8B2RUS7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC50.15■■■■■ 5.62
Abcc8B2RUS7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.15■■■■■ 5.62
Abcc8B2RUS7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC50.13■■■■■ 5.61
Abcc8B2RUS7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.09■■■■■ 5.61
Abcc8B2RUS7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC50.09■■■■■ 5.61
Abcc8B2RUS7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC50.06■■■■■ 5.6
Abcc8B2RUS7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.06■■■■■ 5.6
Abcc8B2RUS7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.06■■■■■ 5.6
Abcc8B2RUS7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.06■■■■■ 5.6
Abcc8B2RUS7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.06■■■■■ 5.6
Abcc8B2RUS7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.06■■■■■ 5.6
Abcc8B2RUS7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC50.04■■■■■ 5.6
Abcc8B2RUS7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.03■■■■■ 5.6
Abcc8B2RUS7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC50.03■■■■■ 5.6
Abcc8B2RUS7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.03■■■■■ 5.6
Abcc8B2RUS7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC50.02■■■■■ 5.6
Abcc8B2RUS7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.01■■■■■ 5.6
Abcc8B2RUS7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50■■■■■ 5.6
Abcc8B2RUS7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC50■■■■■ 5.59
Abcc8B2RUS7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.98■■■■■ 5.59
Abcc8B2RUS7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC49.98■■■■■ 5.59
Abcc8B2RUS7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC49.97■■■■■ 5.59
Abcc8B2RUS7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
Abcc8B2RUS7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC49.96■■■■■ 5.59
Abcc8B2RUS7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
Abcc8B2RUS7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.94■■■■■ 5.59
Abcc8B2RUS7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC49.94■■■■■ 5.59
Abcc8B2RUS7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
Abcc8B2RUS7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.92■■■■■ 5.58
Abcc8B2RUS7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC49.92■■■■■ 5.58
Abcc8B2RUS7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.92■■■■■ 5.58
Abcc8B2RUS7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC49.92■■■■■ 5.58
Abcc8B2RUS7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.91■■■■■ 5.58
Abcc8B2RUS7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.91■■■■■ 5.58
Abcc8B2RUS7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.9■■■■■ 5.58
Abcc8B2RUS7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC49.88■■■■■ 5.58
Abcc8B2RUS7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
Abcc8B2RUS7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
Abcc8B2RUS7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.86■■■■■ 5.57
Abcc8B2RUS7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.84■■■■■ 5.57
Abcc8B2RUS7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.84■■■■■ 5.57
Abcc8B2RUS7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC49.83■■■■■ 5.57
Abcc8B2RUS7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.83■■■■■ 5.57
Abcc8B2RUS7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC49.83■■■■■ 5.57
Abcc8B2RUS7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC49.79■■■■■ 5.56
Abcc8B2RUS7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.79■■■■■ 5.56
Abcc8B2RUS7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC49.79■■■■■ 5.56
Abcc8B2RUS7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC49.79■■■■■ 5.56
Abcc8B2RUS7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC49.78■■■■■ 5.56
Abcc8B2RUS7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.78■■■■■ 5.56
Abcc8B2RUS7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC49.77■■■■■ 5.56
Abcc8B2RUS7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.77■■■■■ 5.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms