Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN2

Igsf23, Immunoglobulin superfamily, member 23, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf23B2RTN2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Igsf23B2RTN2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Igsf23B2RTN2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Igsf23B2RTN2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Igsf23B2RTN2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Igsf23B2RTN2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Igsf23B2RTN2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Igsf23B2RTN2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Igsf23B2RTN2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Igsf23B2RTN2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Igsf23B2RTN2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Igsf23B2RTN2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Igsf23B2RTN2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Igsf23B2RTN2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Igsf23B2RTN2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Igsf23B2RTN2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Igsf23B2RTN2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Igsf23B2RTN2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Igsf23B2RTN2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Igsf23B2RTN2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Igsf23B2RTN2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Igsf23B2RTN2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Igsf23B2RTN2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Igsf23B2RTN2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Igsf23B2RTN2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Igsf23B2RTN2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Igsf23B2RTN2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Igsf23B2RTN2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Igsf23B2RTN2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Igsf23B2RTN2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Igsf23B2RTN2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Igsf23B2RTN2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Igsf23B2RTN2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Igsf23B2RTN2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Igsf23B2RTN2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Igsf23B2RTN2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Igsf23B2RTN2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Igsf23B2RTN2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Igsf23B2RTN2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Igsf23B2RTN2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Igsf23B2RTN2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Igsf23B2RTN2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Igsf23B2RTN2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Igsf23B2RTN2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Igsf23B2RTN2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Igsf23B2RTN2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Igsf23B2RTN2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Igsf23B2RTN2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Igsf23B2RTN2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Igsf23B2RTN2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Igsf23B2RTN2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Igsf23B2RTN2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Igsf23B2RTN2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Igsf23B2RTN2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Igsf23B2RTN2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Igsf23B2RTN2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Igsf23B2RTN2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Igsf23B2RTN2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Igsf23B2RTN2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Igsf23B2RTN2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Igsf23B2RTN2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Igsf23B2RTN2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Igsf23B2RTN2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Igsf23B2RTN2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Igsf23B2RTN2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Igsf23B2RTN2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Igsf23B2RTN2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Igsf23B2RTN2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Igsf23B2RTN2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Igsf23B2RTN2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Igsf23B2RTN2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Igsf23B2RTN2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Igsf23B2RTN2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Igsf23B2RTN2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Igsf23B2RTN2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Igsf23B2RTN2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Igsf23B2RTN2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Igsf23B2RTN2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Igsf23B2RTN2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Igsf23B2RTN2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Igsf23B2RTN2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Igsf23B2RTN2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Igsf23B2RTN2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Igsf23B2RTN2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Igsf23B2RTN2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Igsf23B2RTN2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Igsf23B2RTN2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Igsf23B2RTN2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Igsf23B2RTN2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Igsf23B2RTN2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Igsf23B2RTN2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Igsf23B2RTN2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Igsf23B2RTN2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Igsf23B2RTN2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Igsf23B2RTN2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Igsf23B2RTN2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Igsf23B2RTN2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Igsf23B2RTN2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Igsf23B2RTN2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Igsf23B2RTN2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.2 ms