Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slfn8B1ARD8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slfn8B1ARD8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slfn8B1ARD8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Slfn8B1ARD8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Slfn8B1ARD8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slfn8B1ARD8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slfn8B1ARD8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slfn8B1ARD8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slfn8B1ARD8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slfn8B1ARD8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slfn8B1ARD8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slfn8B1ARD8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slfn8B1ARD8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slfn8B1ARD8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slfn8B1ARD8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slfn8B1ARD8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slfn8B1ARD8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slfn8B1ARD8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slfn8B1ARD8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slfn8B1ARD8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slfn8B1ARD8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slfn8B1ARD8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slfn8B1ARD8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slfn8B1ARD8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slfn8B1ARD8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slfn8B1ARD8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slfn8B1ARD8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slfn8B1ARD8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slfn8B1ARD8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slfn8B1ARD8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slfn8B1ARD8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slfn8B1ARD8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slfn8B1ARD8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slfn8B1ARD8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slfn8B1ARD8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slfn8B1ARD8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slfn8B1ARD8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slfn8B1ARD8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slfn8B1ARD8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slfn8B1ARD8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slfn8B1ARD8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slfn8B1ARD8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slfn8B1ARD8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slfn8B1ARD8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slfn8B1ARD8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slfn8B1ARD8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slfn8B1ARD8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slfn8B1ARD8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slfn8B1ARD8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slfn8B1ARD8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slfn8B1ARD8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slfn8B1ARD8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slfn8B1ARD8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Slfn8B1ARD8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slfn8B1ARD8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slfn8B1ARD8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slfn8B1ARD8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slfn8B1ARD8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slfn8B1ARD8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slfn8B1ARD8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slfn8B1ARD8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slfn8B1ARD8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slfn8B1ARD8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slfn8B1ARD8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slfn8B1ARD8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slfn8B1ARD8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Slfn8B1ARD8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slfn8B1ARD8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slfn8B1ARD8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Slfn8B1ARD8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slfn8B1ARD8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slfn8B1ARD8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slfn8B1ARD8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slfn8B1ARD8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slfn8B1ARD8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slfn8B1ARD8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slfn8B1ARD8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slfn8B1ARD8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slfn8B1ARD8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slfn8B1ARD8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slfn8B1ARD8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slfn8B1ARD8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slfn8B1ARD8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slfn8B1ARD8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slfn8B1ARD8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slfn8B1ARD8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slfn8B1ARD8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slfn8B1ARD8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slfn8B1ARD8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slfn8B1ARD8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slfn8B1ARD8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slfn8B1ARD8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slfn8B1ARD8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slfn8B1ARD8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slfn8B1ARD8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slfn8B1ARD8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slfn8B1ARD8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slfn8B1ARD8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slfn8B1ARD8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms