Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Odf2A3KGV1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Odf2A3KGV1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Odf2A3KGV1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Odf2A3KGV1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Odf2A3KGV1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Odf2A3KGV1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Odf2A3KGV1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Odf2A3KGV1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Odf2A3KGV1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Odf2A3KGV1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Odf2A3KGV1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Odf2A3KGV1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Odf2A3KGV1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Odf2A3KGV1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Odf2A3KGV1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Odf2A3KGV1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Odf2A3KGV1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Odf2A3KGV1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Odf2A3KGV1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Odf2A3KGV1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Odf2A3KGV1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Odf2A3KGV1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Odf2A3KGV1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Odf2A3KGV1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Odf2A3KGV1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Odf2A3KGV1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Odf2A3KGV1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Odf2A3KGV1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Odf2A3KGV1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Odf2A3KGV1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Odf2A3KGV1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Odf2A3KGV1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Odf2A3KGV1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Odf2A3KGV1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Odf2A3KGV1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Odf2A3KGV1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Odf2A3KGV1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Odf2A3KGV1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Odf2A3KGV1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Odf2A3KGV1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Odf2A3KGV1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Odf2A3KGV1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Odf2A3KGV1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Odf2A3KGV1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Odf2A3KGV1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Odf2A3KGV1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Odf2A3KGV1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Odf2A3KGV1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Odf2A3KGV1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Odf2A3KGV1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Odf2A3KGV1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Odf2A3KGV1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Odf2A3KGV1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Odf2A3KGV1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Odf2A3KGV1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Odf2A3KGV1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Odf2A3KGV1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Odf2A3KGV1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Odf2A3KGV1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Odf2A3KGV1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Odf2A3KGV1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Odf2A3KGV1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Odf2A3KGV1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Odf2A3KGV1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Odf2A3KGV1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Odf2A3KGV1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Odf2A3KGV1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Odf2A3KGV1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Odf2A3KGV1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Odf2A3KGV1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Odf2A3KGV1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Odf2A3KGV1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Odf2A3KGV1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Odf2A3KGV1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Odf2A3KGV1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Odf2A3KGV1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Odf2A3KGV1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Odf2A3KGV1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Odf2A3KGV1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Odf2A3KGV1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Odf2A3KGV1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Odf2A3KGV1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Odf2A3KGV1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Odf2A3KGV1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Odf2A3KGV1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Odf2A3KGV1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Odf2A3KGV1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Odf2A3KGV1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Odf2A3KGV1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Odf2A3KGV1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Odf2A3KGV1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Odf2A3KGV1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Odf2A3KGV1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Odf2A3KGV1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Odf2A3KGV1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Odf2A3KGV1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Odf2A3KGV1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Odf2A3KGV1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Odf2A3KGV1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.1 ms