Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pm20d2A3KG59 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pm20d2A3KG59 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pm20d2A3KG59 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pm20d2A3KG59 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pm20d2A3KG59 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pm20d2A3KG59 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pm20d2A3KG59 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pm20d2A3KG59 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pm20d2A3KG59 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pm20d2A3KG59 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pm20d2A3KG59 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pm20d2A3KG59 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pm20d2A3KG59 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pm20d2A3KG59 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pm20d2A3KG59 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pm20d2A3KG59 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pm20d2A3KG59 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pm20d2A3KG59 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pm20d2A3KG59 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pm20d2A3KG59 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pm20d2A3KG59 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pm20d2A3KG59 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pm20d2A3KG59 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pm20d2A3KG59 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pm20d2A3KG59 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pm20d2A3KG59 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pm20d2A3KG59 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pm20d2A3KG59 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pm20d2A3KG59 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pm20d2A3KG59 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Pm20d2A3KG59 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pm20d2A3KG59 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pm20d2A3KG59 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pm20d2A3KG59 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pm20d2A3KG59 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pm20d2A3KG59 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pm20d2A3KG59 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms